湖北省2016－2021年麻疹病毒流行株基因型特征张婷，邹文菁，徐军强，蔡昆，李静(湖北省疾病预防控制中心，湖北武汉430079)DOI:10.19914/j.CJVI.2023007通信作者:李静，Email:412836800@qq．com第一作者Email:626817498@qq．com摘要:目的分析湖北省麻疹病毒流行株基因型特征。方法收集湖北省2016－2021年麻疹监测病例咽拭子标本，进行麻疹病毒核酸检测、分离培养、N基因C末端基因扩增，构建分离株与基因库(GenBank)中麻疹病毒基因型参考株的系统进化树，分析核苷酸同源性和基因型别。结果从湖北省2016－2021年麻疹监测病例中共获得335株麻疹病毒流行株，其中H1基因型327株(2016－2018年)、B3基因型5株(2019年)、疫苗株A基因型3株(2016年和2021年)。H1基因型麻疹病毒分离株之间的核苷酸同源性为98.40%－98.90%，与H1基因型参考株的核苷酸同源性为97.30%－97.80%;B3基因型麻疹病毒分离株之间的核苷酸同源性为99.30%－100%，与B3基因型参考株的核苷酸同源性为97.10%－97.60%。结论2016－2018年湖北省麻疹病毒优势流行株仍为中国本土H1基因型，2019年首次发现B3基因型，2021年仅检测到疫苗株A基因型。需继续加强麻疹病毒基因型监测，及时发现和阻断输入性麻疹传播。关键词:麻疹病毒;基因型;核苷酸;同源性;监测中图分类号:Ｒ511.1文献标识码:A文章编号:1006－916X(2023)01－0035－06GeneticcharacteristicsofmeaslesvirusescirculatinginHubeiprovincefrom2016to2021ZhangTing，ZouWenjing，XuJunqiang，CaiKun，LiJing(HubeiProvincialCenterforDiseaseControlandPrevention，Wuhan430079，Hubei，China)Abstract:ObjectiveToanalyzegeneticcharacteristicsofmeaslesvirus(MV)isolatesinHubeiprovince．MethodsWecollectedthroatswabsfrommeaslescasesreportedbetween2016and2021inHubeiprovinceforMVnucleicaciddetection，isolationandculture，andamplificationoftheC-terminalNgene．WeconstructedaphylogenetictreeoftheMVisolateswithGenBankMVgenotypereferencestrainstodeterminenucleotidehomologiesandgenotypes．ＲesultsAtotalof335MVstrainswereobtainedfrommeaslessurveillancecasesfrom2016to2021inHubei，amongwhich327wereH1genotype(in2016－2018)，5wereB3genotype(in2019)，and3werevaccinestrainAgenotype(in2016and2021)．NucleotidehomologieswithinH1genotypeisolateswere98.40%－98.90%andwere97.30%－97.80%betweenH1genotype...
