第46卷第1期2023年1月河北农业大学学报JOURNALOFHEBEIAGRICULTURALUNIVERSITYVol.46No.1Jan.2023河北苹果坏死花叶病毒的发生及近全基因组序列的测定与分析董震杨，李紫腾，胡同乐，王树桐，王亚南，曹克强（河北农业大学植物保护学院，河北保定071001）摘要：为明确苹果坏死花叶病毒（Applenecroticmosaicvirus,ApNMV）在河北的发生及其基因组特性，本试验利用RT-PCR技术对河北保定两地ApNMV发病情况进行检测，然后通过高通量测序技术对带毒样本进行序列测定和分析。结果表明，河北农大果园‘红珍珠’‘锦锈红’‘信侬红’3个品种及保定唐县苹果实验基地富士品种ApNMV检出率分别为9.09%、18.18%、100%和65%。ApNMV阳性果树高通量测序结果显示，果树为ApNMV、苹果褪绿叶斑病毒（Applechloroticleafspotvirus,ACLSV）、苹果茎沟病毒（Applestemgroovingvirus,ASGV）和苹果茎痘病毒（Applestempittingvirus,ASPV）复合侵染，ApNMV河北分离物（ApNMV-HB）的近全基因组序列包含RNA1～RNA3序列，GenBank登录号分别为OP019626、OP019627和OP019628。RNA1编码120kD的甲基转移酶/NTP-binding解旋酶（MET/HEL），RNA2编码97kD的RNA聚合酶（POL），RNA3编码运动蛋白（Movementprotein,MP）和外壳蛋白（Coatprotein,CP），4个基因核苷酸和氨基酸序列与代表性分离物相似性分别为89.44%～97.02%、92.14%～98.67%。系统发育关系分析表明，以ApNMVRNA1、RNA2、RNA3（CP和MP）编码的氨基酸为基础构建系统发育树，ApNMV-HB分别与AM95、AM125、XJ、ZZ亲缘关系最近。本研究首次揭示了ApNMV河北分离物的近全基因组序列，丰富了该病毒的基因组序列信息，明确了该分离物与其它分离物的系统发育关系，为进一步了解该病毒的系统发育及遗传进化提供参考。关键词：苹果坏死花叶病毒；高通量测序；基因组特性；系统进化中图分类号：S432.1开放科学（资源服务）标识码（OSID）：文献标志码：AOccurrenceofapplenecroticmosaicvirusinHebeiprovinceandsequenceanalysisofitswholegenomeDONGZhenyang,LIZiteng,HUTongle,WANGShutong,WANGYanan,CAOKeqiang（CollegeofPlantProtection,HebeiAgriculturalUniversity,Baoding071001,China）Abstract:Inordertoclarifytheoccurrenceandgenomiccharacteristicsofapplenecroticmosaicvirus(ApNMV)inHebei,theincidenceofApNMVintworegionsofBaodingwasdetectedbyRT-PCR,andthentheinfectedsamplewassequencedbyhigh-throughputsequencingt...
