荷兰进境百合种球中线虫的分离及分子鉴定_张寅寅.pdf

农业环境科学学报Journal of AgroEnvironment Science2022，41（12）:2805-28092022年12月张寅寅，黑多尔，刘玥婷，等.荷兰进境百合种球中线虫的分离及分子鉴定J.农业环境科学学报,2022,41（12）：2805-2809.ZHANG Y Y,HEI D E,LIU Y T,et al.Isolation and molecular identification of nematodes intercepted from imported Netherlands lilybulbsJ.Journal of Agro-Environment Science,2022,41（12）：2805-2809.开放科学OSID荷兰进境百合种球中线虫的分离及分子鉴定张寅寅，黑多尔，刘玥婷，李鑫*（大连海关技术中心，辽宁 大连 116001）Isolation and molecular identification of nematodes intercepted from imported Netherlands lily bulbsZHANG Yinyin,HEI Duoer,LIU Yueting,LI Xin*（Technology Center of Dalian Customs,Dalian 116001,China）Abstract：The increasing import of the Netherlands lily bulbs over the years has meant introduction of a variety of pests into the country;and one such nematode pest has turned into risk,endangering the national biosafety.Quarantine and identification of nematodes are thusimperative.This paper provides reference for the quarantine of imported seedlings and flowers to various ports and the supervision ofplanting sites.In this study,morphology（Beeman funnel method）,combined with molecular biological methods（DNA extraction and PCRamplification）,were used to quarantine and identify plant parasitic nematodes isolated from lily bulbs.The results showed that threespecies of plant parasitic nematodes were found：Pratylenchus penetrans,Aphelenchoides blastophthorus,and Aphelenchus avenae.Theresults also indicated that the quantity of nematodes isolated from the imported lily bulbs was limited,with most being larvae,as is itdifficult to accurately identify nematodes based on their morphology,this process needed to be supplemented by molecular biologicalmethods to ensure the accuracy of the results.Keywords：Netherlands;lily bulb;nematode;molecular identification收稿日期：2022-11-10录用日期：2022-12-06作者简介：张寅寅（1987），女，辽宁大连人，硕士，从事植物检疫工作。E-mail：黑多尔与张寅寅同等贡献*通信作者：李鑫E-mail：基金项目：“十四五”国家重点研发计划课题（2021YFD1400100）Project supported：The National Key Research and Development Project During the 14th Five-Year Plan of China（2021YFD1400100）摘要：随着荷兰百合种球的进口量逐年增加，其极易携带多种有害生物入境，线虫传入风险随之增大，危害国门生物安全，因此对其准确的检疫鉴定十分重要。本文采用形态学（改良贝曼漏斗法）结合分子生物学方法（DNA提取及PCR扩增）对百合种球中分离到的植物寄生线虫进行分离鉴定。最终鉴定出 3 个种类，分别为穿刺短体线虫（Pratylenchus penetrans）、毁芽滑刃线虫（Aphelenchoides blastophthorus）和燕麦真滑刃线虫（Aphelenchus avenae）。研究表明，在进境百合种球中分离到的线虫数量有限、幼虫较多，无法通过形态学准确鉴定，应结合分子生物学方法保证结果的准确性。关键词：荷兰；百合种球；线虫；分子鉴定中图分类号：S436.8文献标志码：A文章编号：1672-2043（2022）12-2805-05doi:10.11654/jaes.2022-1141随着国内鲜花消费需求的逐步提升，优质百合花的需求量逐年增加，荷兰是世界上最大的百合种球等花卉生产国1，我国每年从荷兰进口大量百合种球，其已成为我国主要的鲜切花品种。百合种球极易携带线虫随贸易进入我国2，近年来，在我国口岸检疫工作中多次截获重要线虫3-4。线虫是一种最难鉴定的动物之一，目前随着分子生物学的不断发展，基于DNA的分子生物学鉴定方法已广泛应用于线虫的检农业环境科学学报第41卷第12期疫鉴定中。国内外的研究人员主要采用线虫 18S、28S核糖体基因、ITS区和线粒体基因的核苷酸序列，作为识别线虫的“条形码”，以建立线虫的DNA分类学5。近年来以上述序列作为分子标记在线虫鉴定中得到广泛应用6-7，尤其在口岸截获线虫为幼虫、近似种难以区分时，常采用形态学方法与分子生物学技术相结合的综合鉴定方法8-9，以保证鉴定结果的准确性。本文针对进境的荷兰百合种球进行线虫分离，采用形态学初步判断结合分子生物学技术进行检疫鉴定，最终获得植物寄生线虫3种。本研究为进境种苗花卉中线虫的检疫鉴定及后续监管防治提供了参考依据。1材料与方法1.1 线虫分离将百合种球的鳞球茎、根（重点选取有根腐症状的）及介质一并搜集，采用改良贝曼漏斗法（Beemanfunnel method）分离线虫，室温保持在 2028，24 h后用凹面皿接取水样约 5 mL，置于 ZEISS Stemi 508体视显微镜下观察。1.2 形态学鉴定经体视显微镜观察后，挑取待检线虫，采用SEINHORST10发明的丙三醇-乙醇脱水法制作永久玻片，在Leica DM3000显微镜下进行形态观察，根据形态特征进行初步判断，并搜集该线虫以备分子生物学鉴定。1.3 分子生物学鉴定由于线虫的形态特征变异较大，进境百合种球中分离到的线虫数量有限、幼虫较多，很难仅依靠形态特征对线虫进行准确鉴定11。因此，在形态学初步判断的基础上，结合分子生物学鉴定方法对线虫种属进一步确认。1.3.1 线虫DNA提取在200 L PCR管中加入8 L ddH2O和1 L 10PCR Buffer（Mg2+free），挑取待检的单条线虫放入ddH2O清洗后加入上述PCR管，将PCR管置于液氮中1 min，取出后置于85 水浴加热2 min，再向PCR管中加入 1 L 1 mgmL-1蛋白酶 K，56 水浴加热 15min，95 水浴加热10 min，得到待检线虫的DNA提取液，可直接用于PCR扩增。1.3.2 引物合成、PCR扩增及产物测序选择核糖体 DNA 的 28 S D2/D3 区引物对进行扩增，引物为 D2A（5-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTG-3）和 D3B（5-TCGGAAGGAACCAGCTACTA-3）12，以提取的待测线虫DNA为模板，按反应体系（表1）及条件（表2）进行PCR扩增，将PCR产物送至生物公司测序，将测序结果BLAST比对分析。引物合成、试剂、测序服务均购于大连宝生物公司。2结果与分析2.1 穿刺短体线虫（Pratylenchus penetrans）分类地位：根据 van den Berg&Esther 最新分类系统，该线虫属于动物界（Animalia），线虫门（Nematoda），有腺纲（Adenophorea），双胃亚纲（Diplogasteria），垫刃线虫目（Tylenchida），垫刃总科（Tylenchoidea），短体科（Pratylenchidae），短体亚科（Pratylenchuinae），短体线虫属（Pratylenchus）。2.1.1 形态特征描述雌虫：虫体粗短，唇区较低平且无缢缩（图1）。口针强壮，基部球发达，中食道球卵圆形，约占该处体宽的1/22/3，阴门位于虫体约4/5处，尾部圆柱形，末端宽圆。雄虫：形态与雌虫相近，交合刺细，交合伞边缘呈不规则锯齿状，包裹至尾端。2.1.2 分子生物学结果分析将搜集到的雌虫、雄虫分别提取其 DNA，采用D2A/D3B引物对分别进行PCR扩增，获得长度均为750 bp左右的片段，测序后BLAST比对，结果表明雌表1 PCR反应体系Table 1 PCR reaction system试剂ReagentTaKaRa LA Taq（5UL-1）10LA Taq Buffer （Mg2+plus）dNTP Mixture（2.5 mmolL-1each）引物D2A引物D3BTemplate DNAdH2O使用量Usage0.5 L5 L8 L1 L1 L1 g50 L最终浓度Final concentration0.4 molL-10.4 molL-1表2 PCR反应条件Table 2 PCR reaction conditions温度Temperature/94986872时间Time1 min10 s15 min10 min循环数Cycle302806张寅寅，等：荷兰进境百合种球中线虫的分离及分子鉴定2022年12月虫的序列与 GenBank 中已登录的穿刺短体线虫KP161612.1 序 列 相 似 性 为 97%，雄 虫 序 列 与JX046990.1序列相似性为98%，因此鉴定该线虫为穿刺短体线虫（P.penetrans）。2.2 毁芽滑刃线虫（Aphelenchoides blastophthorus）分类地位：动物界（Animalia），线虫门（Nematoda），色矛纲（Chromadorea），色矛亚纲（Chromadoria），小杆目（Rhabditida），真滑刃总科（Aphelenchoidea），滑刃科（Aphelenchoididae），滑刃亚科（Aphelenchoidinae），滑刃属（Aphelenchoides）。2.2.1 形态特征描述雌虫：整个虫体细长，热杀死后虫体略向腹面弯，头部半球形，口针细，唇区缢缩不明显，中食道球卵圆形，食道球发达，尾部近圆柱形，尾端有尾尖突（图2）。雄虫：未见。2.2.2 分子生物学结果分析提取搜集到的雌虫的DNA，采用D2A/D3B引物对扩增，获得长度为750 bp左右的产物片段，测序并BLAST比对，结果表明该雌虫序列与GenBank中已登录的毁芽滑刃线虫MK981894.1序列相似性为9