第14卷第2期食品安全质量检测学报Vol.14No.22023年1月JournalofFoodSafetyandQualityJan.,2023基金项目:国家重点研发计划项目(2020YFD0900704)、辽宁省教育厅科技项目(DL202002)Fund:SupportedbyNationalKeyResearchandDevelopmentProgramofChina(2020YFD0900704),andtheScienceandTechnologyProjectofLiaoningProvincialDepartmentofEducation(DL202002)*通信作者:马永生,博士,副教授,主要研究方向为水产品质量安全与控制。E-mail:mayo@dlou.edu.cn*Correspondingauthor:MAYong-Sheng,Ph.D,AssociateProfessor,DalianOceanUniversity,No.52,HeishijiaoRoad,ShahekouDistrict,Dalian116000,China.E-mail:mayo@dlou.edu.cn仿刺参胶原蛋白源二肽基肽酶抑制肽虚拟筛选及分子对接研究曲亭菲1,赵前程1,李双双2,韩明哲1,李嘉欣1,马永生1*(1.大连海洋大学食品科学与工程学院,大连116000;2.大连鑫玉龙海洋生物种业科技股份有限公司,大连116200)摘要:目的采用生物信息学和分子对接方法筛选仿刺参胶原蛋白来源的二肽基肽酶(dipeptidylpeptidase-IV,DPP-IV)抑制肽。方法以仿刺参胶原蛋白序列为对象，进行生物信息学分析和计算机辅助虚拟酶解,基于生物毒性、致敏性、水溶性及吸收、分配、代谢、排泄及毒性(absorption,distribution,metabolism,excretion,toxicity,ADMET)预测,筛选得到6条具有潜在生物活性的寡肽,氨基酸序列分别为CD、CQ、CS、GR、SM、MDG,进一步通过分子对接分析肽段与DPP-Ⅳ的结合活性,并分析其结合位点及方式。结果生物信息学分析表明仿刺参胶原蛋白是生物活性肽的潜在优良来源,经木瓜蛋白酶、碱性蛋白酶及模拟胃肠道虚拟水解后能够释放出DPP-Ⅳ抑制肽;分子对接表明俩条新肽段CS、SM通过氢键、疏水相互作用分别与DPP-IV的S1、S2活性口袋结合。结论本研究提供了一种快速筛选刺参胶原蛋白中DPP-IV抑制肽的方法。关键词:仿刺参;虚拟酶解;分子对接;生物活性肽;二肽基肽酶;Ⅱ型糖尿病Virtualscreeningandmoleculardockingofdipeptidylpeptidase-IVinhibitorypeptidesderivedfromcollagenofApostichopusjaponicusQUTing-Fei1,ZHAOQian-Cheng1,LIShuang-Shuang2,HANMing-Zhe1,LIJia-Xin1,MAYong-Sheng1*(1.CollegeofFoodScienceandEngineering,DalianOceanUniversity,Dalian116000,China;2.DalianXinyulongMarineOrganismsSeedIndustryTechnologyCo.,Ltd.,Dalian116200,China)ABSTRACT:ObjectiveToscreenthedipeptidylpeptidase-IV(DPP-IV)inhibitor...
