多种遗传学检测技术在脐血穿刺中的临床应用研究_袁慧珍.pdf

江西医药2022年11月 第57卷 第11期Jiangxi Medical Journal，November 2022，Vol 57，No11摘要：目的探讨多种遗传学检测技术在脐血穿刺中的临床应用价值。方法回顾性分析本院2019年1月至2021年7月576例脐血穿刺，应用染色体核型分析、荧光定量聚合酶链反应(QF-PCR)、染色体微阵列分析(CMA)及荧光原位杂交(FISH)等技术，对检测结果进行比较和分析。结果在576例脐血穿刺中，经染色体核型分析共发现染色体核型异常78例和染色体多态性变异42例，胎儿染色体核型异常检出率13.54%（78/576），其中染色体数目异常占78.20%（61/78），染色体结构异常占21.80%（17/78）；常染色体异常占66.67%（52/78）,三体综合征占65.38%（51/78），其中最多的是21-三体综合征，占51.28%（40/78）；性染色体异常占20.51%（16/78）。FISH结果与染色体核型结果一致。染色体微阵列分析发现，与核型分析结果不一致且具有临床意义的拷贝数变异21例，额外增加了3.65%（21/576）的异常检出率。QF-PCR检测发现，1例脐带血存在一定比例的母源污染,其他均无母体细胞污染。无法判断是否存在18号染色体数目异常2例，其余与染色体核型结果一致。结论联合多种遗传学检测技术，有利于提高遗传学异常的检出率，从而降低出生缺陷率，提高出生人口素质。关键词：脐血穿刺；染色体核型分析；荧光定量聚合酶链反应；染色体微阵列分析；荧光原位杂交中图分类号：R714.5文献标识码：B文章编号：1006-2238(2022)11-1973-04DOI：10.3969/j.issn.1006-2238.2022.11.084多种遗传学检测技术在脐血穿刺中的临床应用研究袁慧珍，刘艳秋，周萍，王欣荣，黄淑晖（江西省妇幼保健院医学遗传中心 江西省出生缺陷防控重点实验室 江西省医学领先学科建设计划项目，南昌 330006）基金项目：江西省卫生健康委科技计划项目，编号 20203619；江西省卫生健康委科技计划项目，编号 202130789；江西省中医药管理局科技计划项目，编号 2020A0129通信作者：刘艳秋据统计全世界每年有500多万出生缺陷，我国每年出生缺陷儿100多万，占出生人口的5%。其中遗传因素占25%，环境因素约占10%；遗传和环境综合或病因未知占65%1。如果染色体发生数目或结构的异常，将会引起许多基因的缺失或重复，因而染色体病常表现为多种异常或畸形的综合征2。近年随着产前分子诊断遗传学技术的发展，荧光原位杂交（Fluorescence In Situ Hybridiza-tion，FISH）技术、荧光定量聚合酶链反应（Quanti-tative Fluorescent Polymerase Chain Reaction，QF-PCR）技术、染色体微阵列技术（Chromosomal Mi-croarray Analysis，CMA）、低深度全基因组拷贝数变 异 测 序(Copy Number Variation Sequencing，CNV-seq)等已逐渐成熟及广泛应用于临床，其中QF-PCR可以根据短串联重复序列(Short Trandemrepeat，STR)等位基因的个性化信息判别多余染色体的来源，鉴别母体细胞污染（Maternal Cell Con-tamination，MCC），也可快速诊断出目标染色体的非整倍体数目异常3；CMA缓解了传统核型分析的压力，同时在深度上更详细地对染色体数目和结构进行分析，并能综合染色体微缺失微重复的片段位置、大小、来源及数据库和相关文献对其致病性进行评估4。妊娠中晚期抽取脐血进行染色体分析是产前诊断的主要方法之一，本文对576例胎儿脐血染色体检查的结果进行了回顾性分析，现报告如下。1资料与方法1.1一般资料2019年1月至2021年4月在江西省妇幼保健院产前诊断中心行脐血穿刺的孕妇576例，均进行染色体核型分析、QF-PCR及CMA检测，孕周24周，年龄1839岁；若无创DNA提示胎儿性染色体异常，同时进行FISH检测。脐血穿刺指征：超声提示胎儿发育异常、夫妇之一为染色体异常携带者、母血中胎儿游离DNA检测（non-invasive prenatal test，NIPT）阳性、不良生育史等。所有孕妇均签署知情同意书。1.2方法 在超声引导下抽取24 mL脐血标本进行染色体核型分析、QF-PCR及CMA检测；若无创DNA检测结果提示性染色体异常，同时进行FISH检测。查询国际数据库包括DECIPHER、Databaseof Genomic Variants(DGV)、Online Mendelian In-herit-ance in Man(OMIM)、UCSC Genome Browser、检测与诊断 1973江西医药2022年11月 第57卷 第11期Jiangxi Medical Journal，November 2022，Vol 57，No11ENS EMBL等 进 行 致 病 性 分 析，依 据ACMG（American College of Medical Genetics and Ge-nomics）判读指南进行CNVs致病性的判读。2结果2.1染色体核型与FISH结果 在576例脐血穿刺中，经染色体核型分析共发现染色体核型异常78例和染色体多态性变异42例，胎儿染色体核型异常检出率13.54%（78/576），其中染色体数目异常占78.20%（61/78），染色体结构异常占21.80%（17/78）；常染色体异常占66.67%（52/78），三体综合征占65.38%（51/78），其中最多的是21-三体综合征，占51.28%（40/78）；性染色体异常占20.51%（16/78）。FISH结果与染色体核型结果一致。见表1。2.2染色体微阵列分析结果与核型分析结果不一致且具有临床意义的拷贝数变异21例，额外增加了3.65%（21/576）的异常检出率。见表2。分类核型例数分类核型例数常染色体数目异常47,XN,+213647,XN,+18647,XN,+13147,XN,inv(9)(p11q13),+211常染色体结构异常46,XN,t(3；13)(p24;q22)146,XN,t(4;18)(p15；q21）146,XN,t(5；12)(q31;q24.1)146,XN,t(8;11)(q21.2;q13)146,XN,t(17;20)(q23;q13.2)146,XN,rob(13；21)146,XN,inv(1)(p13;q21)146,XN,del(1)(q43)146,XN,del(3)(p25)146,XN,del(3)(q11.2q13.13)146,XN,del(8)(p21)146,XN,del(11)(q24)146,XN,add(6)(q27)1常染色体嵌合体46,XN5/47,XN,+2173147,XN,+2130/46,XN20146,XN,dup(14)(q24q32)7/46,XN43147,XN,+mar18/46,XN32147,XN,+mar46/46,XN41性染色体数目异常47,XYY147,XXY5性染色体结构异常46,X,inv(Y)(p11q11)146,X,inv(Y)(p11.2q11.2),9qh+146,X,inv(Y)(p11q11)pat146,X,add(X)(p22.1)1性染色体嵌合体47,XYY9/46,XY41147,XXX8/46,XX41145.X019/46,X,i(X)(q20)35145,X04/46,XX47145,X27/46,X,psu dic(X)(q28)23145,X040/47,XXX201染色体多态性变异46,XN,1qh+1746,XN,1qh+,14ps+146,XN,inv(9)(p11q13)946,XN,9qh+246,XN,13ps+246,XN,13pstk+146,XN,14ps+246,XN,15pstk+346,XN,16qh+146,XN,22ps+346,X,Yqs+,1qh+1表 1 染色体异常核型及多态性变异核型1例脐带血存在一定比例的母源污染，通知孕妇重新取样检测，重新取样后的检测结果与染色体核型结果一致；其他均无母体细胞污染。无法判断是否存在18号染色体数目异常2例，其余与染色体核型结果一致。3讨论染色体是遗传物质的载体，由DNA和蛋白质等构成，具有储存和传递遗传信息的作用。如果染色体发生数目或结构的异常，将会引起许多基因的缺失或重复，因而染色体病常表现为多种异常或畸形的综合征，又称为染色体综合征2。本研究中，在576例脐血穿刺中，检出染色体核型异常78例和染色体微缺失微重复综合征21例，胎儿染色体异常的检出率为17.19%（99/576），1974江西医药2022年11月 第57卷 第11期Jiangxi Medical Journal，November 2022，Vol 57，No11表 2 21 例与核型分析结果不一致具有临床意义的拷贝数变异汇总表编号染色体微阵列分析结果核型临床意义1arrhg19 16p11.2(31,960,137-33,814,325)146,XN,13pstk+致病性2arrhg19 22q11.21(18,648,855-20,304,749)146,XN致病性3arrGRCh37 Xp22.31(6455151-8135568)046,XN致病性4arrGRCh37 17q12(34,822,465-36,307,773)146,XN致病性5arrGRCh37 22q11.21(18648855_21800471)146,XN致病性6arrGRCh37 10q24.1q26.3(97870552_135426386)2-346,XN致病性7arrGRCh37 22q11.21q11.22(21804596_23258939)346,XN致病性8arrGRCh37 14q31.3(86802419_88274016)146,XN可能致病9arrGRCh37 2q37.2q37.3(235722653_242782258)146,XN致病性10arrGRCh37 16p11.2(29428531_30190029)146,XN致病性11arrGRCh37 16p13.11p12.3(15438164_18242713)146,XN致病性12arrGRCh37 16p11.2(29591326_30176508)146,XN致病性13arrGRCh37 1q21.1q44(145214242_249224684)2-346,XN可能致病14arrGRCh37 8q13.3(71314082_73322915)146,XN,t(8;11)致病性15arrGRCh37 22q11.21(18916842_21058888)146,XN致病性16arrGRCh37 1p21.1q23.1(105438124_157720286)347,XN,+mar18/46,XN32致病性17arrGRCh37 22q11.21(18648855_21800471)146,XN致病性18arrGRCh37 Xp22.31(6455151_8134765)046,XN致病性19arrGRCh37 7q11.23(72621722_74136633)117p11.2(16600022_18256678)346,XN致病性20arrGRCh37 17q12(34477479_36393574)146,XN,inv(9)致病性21arrGRCh37 22q11.21(18631364_21800471)146,XN致病性其 中 胎 儿 染 色 体 核 型 异 常 检 出 率13.54%（78/576），染色体微阵列分析提高了3.65%（21/576）的异常检出率。