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低氧性大鼠肺动脉平滑肌细胞tsRNA的表达谱分析_韦雅芹.pdfVIP免费

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老年医学与保健2023年第29卷第1期GeriatrHealthCare,2023,Vol.29.No.1·128·低氧性大鼠肺动脉平滑肌细胞tsRNA的表达谱分析韦雅芹1,夏世金1,陈塑宇2,邰先桃21.复旦大学附属华东医院上海市老年医学研究所,上海200040;2.云南中医药大学第二临床医学院,云南昆明650500基金项目:国家自然科学基金面上项目(81870044)通信作者:夏世金,电子信箱:xiashijinhd@163.com;邰先桃,电子信箱:taixiantao@163.com[摘要]目的观察低氧性大鼠肺动脉平滑肌细胞(ratpulmonaryarterysmoothmusclecells,RPASMCs)中1类新型非编码RNA⁃tRNA衍生的小RNA(tRNA⁃derivedsmallRNA,tsRNA)表达情况。方法采用1%O2的低氧培养箱和常氧培养箱分别培养RPASMCs24h,通过tsRNA高通量测序技术和生物信息学检测并分析RPASMCs中tsRNA的表达差异。结果tsRNA高通量测序检测到3806个tsRNA,其中具有明确类型的有504个(上调的tsRNA有195个,下调的tsRNA有309个),差异表达的上调和下调的tsRNA分别为116个和156个,在进一步剔除掉片段长度<16nt的tsRNA之后,与常氧培养比较,低氧处理的RPASMCs表达显著上调的tsRNA有59个(P<0.01),表达显著下调的tsRNA有9个(P<0.01)。结论低氧刺激RPASMC后,tsRNA表达存在明显差异,可能影响PASMC增殖、凋亡和迁移等功能,可为深入阐明低氧性肺动脉高压的发生机制提供新方法和新思路。[关键词]肺动脉平滑肌细胞;大鼠;tRNA衍生的小RNA;转运RNA;非编码RNA;低氧性肺动脉高压AnalysisofexpressionprofileoftsRNAinpulmonaryarterysmoothmusclecellsofhypoxicratsWeiYaqin1,XiaShijin1∗,ChenSuyu2,TaiXiantao2∗1.ShanghaiInstituteofGeriatrics,HuadongHospital,FudanUniversity,Shanghai,200040,P.R.China;2.SecondClinic...

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