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国自然酸校长加餐-2018.11.06.pdfVIP免费

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现在开始转播昨晚酸菜的加餐,放在这里大家有空时学习。首先我们有2篇借鉴的文献,来自于同一个实验室的,套路非常相似。同学们反馈案例文献比较难,做减法自己搞不定,我先把辅文献JCI那篇的逻辑论证结构揭晓给大家。这篇文章同样是lncRNA结合蛋白调控下游基因转录,套路与案例几乎一模一样,区别在于少了一个TAM的嵌套,这样逻辑上稍微简单一点。连H3K4Me3的横纵嵌套,都是一样的,高水平实验室,做直接机制发高分文章也一样的套路。我们直接把减掉TAM细胞交互后的科学假设结构提炼出来,会发现比课程案例里讲解的更简单一些。即使是剪掉了TAM肿瘤相关巨噬细胞,它依然是一个细胞交互结构,是肿瘤细胞作为供体细胞分泌因子去影响淋巴管内皮细胞,淋巴管内皮细胞是个受体细胞。那么在肿瘤细胞当中,LncRNA有一套直接交互的机制,它通过与蛋白结合去影响VEGFC,1个能够调控淋巴管内皮细胞增殖的明星细胞因子。所以他的科学假设嵌套结构是:膀胱癌淋巴转移的问题,淋巴转移当中聚焦到淋巴管新生是怎么发生的。那么这个信号来自于肿瘤细胞对微环境的改造分泌VEGFC。而它分泌的上游因子是有一条新的LncRNA,这是一个创新的主变量。LncRNA通过结合蛋白来调控VEGFC。不管是从转录水平也好,转录后也好,翻译调控也好,都是某种直接作用机制来影响它的分泌,形成细胞交互。这样一个课题,你可以设想一下,根据我们辅文献的这个参考,他一共可以分成五条逻辑链条跟我们的案例文献是相似的。首先你要提出来LncRNA和淋巴转移的问题,这个跟前面一样,因为他是肿瘤细胞里表达的一个LncRNA。第二步,要去研究它的表型,这也跟前面一样。因为我们只是省掉了肿瘤相关巨噬细胞这一步。所以这些实验的细胞模型,动物模型,那些数据格式跟我们的案例文献都是一致的,我们只要借鉴过来就可以了,这个数据框架。第三条逻辑,是LncRNA直接会影响VEGFC,这是跟前面那个案例不一样的地方,他没有经由CCL2的表达和介导TAM的变化直接到了VEGFC。要证明LncRNA介导VEGFC依赖于VEGFC去影响淋巴管新生影响淋巴转移,可以有个rescue设计。这个案例文献也一样,下一个逻辑是在细节上面进行探究,就lncRNA怎样调节VEGFC的转录的或者不做转录调控做其他水平的也是可以的,这里要介入一个RNA和蛋白的交互作用关系。因为LncRNA就两种主要的作用机制模式。第一种去做ceRNA,但是那个已经有点俗了,现在比较流行的主要是研究RNA和蛋白的交互。因为蛋白有各种各样不同的功能,你跟他交互之...

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