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课件 9
NSFC案例精讲班(三)解螺旋课堂 2017 老谈 解 螺 旋 课 堂 0 课 程 内 容 文献案例分析 科学假设模式 1 3 2 标书写作讲解 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 1.Structure,conservation and heterologous expression of ciRS-7 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 2.Interaction between ciRS-7 and miR-7.DCP1A:marker for P-body which participates the process of RNAi 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 3.ciRS-7 acts as a sponge for miR-7 activity 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 4.Circular Sry RNA interacts with miR-138 Sry(circRNA):sex-determining region Y 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 临床问题 机制 效应 科学问题 分子 科学假设:逻辑思路:A 准备分子工具 ciRS-7/ciRS-7-fs/ciRS-7-ir Fig.1 B Fig.2 C Fig.3 D Fig.4 相互作用 ciRS-7/miR-7 定位、功能 Sponge miR-7/ciRS-7 Sponge 功能的 广泛性 miR-138/Sry 无 miR-7 Sponge circRNA 的作用?ciRS-7 科学假设:解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 1.Identification of circular RNAs by RNA-seq analyses in gastric cancer.SRPBM:spliced reads per billion mapping 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 2.The characteristics of the circular RNA circPVT1 in gastric cancer cells.解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 3.circPVT1 is frequently up-regulated in gastric cancer due to DNA amplification 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 4.Silencing of circPVT1 inhibits the proliferation of gastric cancer cells.解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 5.circPVT1 serves as a miRNA sponge for the miR-125 family 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 6.circPVT1 is an independent prognostic marker of survival in patients with gastric cancer 解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 Fig 7.Combination of circPVT1 and PVT1 expression predicts a better prognosis of patients with gastric cancer.解 螺 旋 课 堂 1 文 献 案 例 分 析 胃癌 miR-125 临床意义 癌症的发生 circPVT1 科学假设:A 筛选 circPVT1 Fig.1 B Fig.2 C Fig.3 D Fig.5 Sponge 逻辑思路:E F Fig.7 circPVT1 的定位及表达调控 细胞内定位/半衰期 circPVT1 高表达的原因 基因扩增 Fig.4 circPVT1 的癌基因功能验证 circPVT1 与 miR-125 之间的sponge 作用 Fig.6 circPVT1 可以作为预后的marker circPVT1 与PVT1 联合使用,判断预后 G 解 螺 旋 课 堂 2 科 学 假 设 模 式 延伸 机制 疾病 临床 问题 科学热点 分子(X)机制(Y)效应(Z)1 2 3 4 5 前期工作 科学问题 临床问题 circRNA miRNA 功能 A 解 螺 旋 课 堂 3 标 书 写 作 讲 解 案例 1)题目:环状RNA circX 调控miR-21影响下游HIF-1通路对胶质瘤恶性增殖/转移过程的作用机制研究 胶质瘤 HIF-1 通路 circX 增殖/转移 miR-21 2)假设:1 胶质瘤恶性程度高,致死率高,目前缺乏有效治疗手段 目前缺乏有效的诊断标志物和治疗标志物 2 申请人通过芯片筛选,发现circX分子在胶质瘤中表达显著升高 3 4 已证实circX与miR-21相互作用,发挥sponge功能,并影响下游HIF-1通路 5 本项目拟开展工作 3)立项依据:Mini-review 600-800 字 Mini-review 600-800 字 Mini-review 800-1000 字 Mini-review 600-800 字 400 字 解 螺 旋 课 堂 3 标 书 写 作 讲 解 案例(一)4)研究内容与研究目的:3 1 2 3 circX影响胶质瘤表型的功能作用 解析miR-21下游靶基因介导的细胞通路和信号 验证胶质瘤中circX表达作为胶质瘤分子标志物的转化应用与临床应用价值 1 circX 过表达/敲减,对于胶质瘤细胞系增殖/转移等表型的影响 细胞水平 2 分子水平 阐明miR-21调控其下游靶基因并影响HIF-1通路的分子机制,明确其下游效应分子途径 3 临床水平 在胶质瘤样品中检测circX分子的表达,结合其他分子标记统计分析其与胶质瘤病理生理指标的相关性 解 螺 旋 课 堂 3 标 书 写 作 讲 解 案例(一)5)研究创新点 6)拟解决关键科学问题 1 2 首次发现circX与胶质瘤发生/转移的关系 circX分子与miR-21相互作用,影响miR-21下游靶基因并调控HIF-1通路 1 2 胶质瘤组织/细胞中,circX的表达及其对胶质瘤恶性表型的作用 miR-21下游靶基因,受到“分子海绵“作用的调控,及其影响下游HIF-1信号通路中的作用 THANKS 2016-12-28

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