·论著·基于GEO数据库的生物信息学分析筛选抑郁症诊断标志物张敏,和申,丁蕾,金锋,黄佳,蔡亦蕴,彭代辉摘要:目的:通过生物信息学分析方法筛选潜在的抑郁症诊断标志物,探讨这些基因在抑郁症疾病过程中的生物作用。方法:GSE98793数据集包含128位抑郁症患者,64位健康对照的外周血表达谱芯片数据,采用R语言Limma包,以|log2FC|>0.1,P<0.05为标准,分析数据集中的差异表达基因,并使用在线网站Metascape分析基因功能,对这些差异表达基因进行批量ROC分析,筛选出AUC最大的前30个差异表达基因,通过Lasso回归和多元逻辑回归构建抑郁症诊断模型,并采用Bootstrap方法进行内部验证。结果:构建出包含GZMK,RETN,CD48,LOC153684,FZD5,DAO,SERTAD2这7个差异基因在内的抑郁症诊断模型,其AUC=0.8861(95%CI=0.84~0.93),模型内部验证证实其具有较好的区分度及校准度。结论:本研究通过基因表达谱数据分析,获得包含7个基因在内的抑郁症诊断模型,并发现该模型具有较高的诊断价值。关键词:生物信息学;抑郁症;差异表达基因;诊断模型中图分类号:R749.4文献标识码:A文章编号:10053220(2023)04027604ScreeningofdepressiondiagnosticmarkersbasedonbioinformaticsanalysisofGeneExpressionOmnibusdatabaseZHANGMin,HEShen,DINGLei,JINGFeng,HUANGJia,CAIYiyun,PENGDaihui.DepartmentofMoodDisorders,ShanghaiMentalHealthCenter,ChinaAbstract:Objective:Tofindthepotentialdiagnosticmarkersofdepressionbybioinformaticsanalysistoexplorethebiologicalrolesofthesegenesintheprocessofdepression.Method:TheGSE98793datasetcontainstheperipheralbloodexpressionprofile...