中草药2023年3月第54卷第5期ChineseTraditionalandHerbalDrugs2023MarchVol.54No.5·1561·藏药多刺绿绒蒿MYB转录因子家族的鉴定与分析3郭佳妮1，向妮艳1，张文才1，陈忠海1，刘星1,3*，丁亚丽2*1.西藏大学理学院青藏高原生态与环境研究中心极端环境生物适应与进化实验室，西藏拉萨8500002.西藏大学医学院，西藏拉萨8500003.武汉大学生命科学学院，湖北武汉430072摘要：目的对多刺绿绒蒿MeconopsishorridulaMYB转录因子家族的鉴定分析，为多刺绿绒蒿MYB转录因子的生物学功能研究提供理论依据。方法基于转录组测序数据，利用生物信息学方法对多刺绿绒蒿MYB转录因子家族成员进行鉴定，并对其理化性质、二级结构、系统进化、保守基序和表达模式进行分析。结果多刺绿绒蒿中共鉴定到106个MYB转录因子，包括49个1R-MYB、52个R2R3-MYB、5个3R-MYB转录因子。多刺绿绒蒿MYB转录因子氨基酸数目为72～976，蛋白相对分子质量为8750～110680，等电点为4.720～10.452，不稳定系数为28.348～71.011。MYB转录因子均为亲水性蛋白质，亚细胞定位预测主要在细胞核中，蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。系统发育分析显示多刺绿绒蒿R2R3-MYB分为24个亚组，其中有18个亚组能分别与拟南芥各亚组聚类。106个MYB转录因子中，28个转录因子的表达量随海拔升高而升高，11个转录因子表达量随海拔升高而降低。结论首次对多刺绿绒蒿MYB转录因子家族进行了鉴定分析，为深入研究MYB转录因子在多刺绿绒蒿生长发育中的作用和应对高原极端环境的调控机制提供了基础数据和理论依据。关键词：多刺绿绒蒿；MYB转录因子；生物信息学分析；基因表达；α-螺旋中图分类号：R282.12文献标志码：A文章编号：0253-2670(2023)05-1561-13DOI:10.7501/j.issn.0253-2670.2023.05.023IdentificationandanalysisofMYBtranscriptionfactorfamilyinTibetanmedicineMeconopsishorridulaGUOJia-ni1,XIANGNi-yan1,ZHANGWen-cai1,CHENZhong-hai1,LIUXing1,3,DINGYa-li21.LaboratoryofExtremeEnvironmentBiologicalResourcesandAdaptiveEvolution,ResearchCenterforEcology,CollegeofScience,TibetUniversity,Lhasa850000,China2.CollegeofMedicine,TibetUniversity,Lhasa850000,China3.CollegeofLifeSciences,WuhanUniversity,Wuhan430072,ChinaAbstract:ObjectiveToidentifyandanalyzeMYBtranscriptionfactorfamilyofMeconopsishorridula,soastoprovideatheoreticalbasisforbiologicalfunctionresearch...
