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GSTM5在前列腺癌中的表...其对前列腺癌进展的潜在机制_张莹.pdfVIP免费

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第44卷第1期2023年1月西安交通大学学报(医学版)JournalofXi’anJiaotongUniversity(MedicalSciences)Vol.44No.1Jan.2023本刊网址:http://yxxb.xjtu.edu.cn微信公众号:西安交通大学学报医学版◇临床研究◇GSTM5在前列腺癌中的表达及其对前列腺癌进展的潜在机制张莹1,孙娜1,郭亚收2,史传道1,刘一笑1(1.陕西中医药大学公共卫生学院,陕西咸阳712046;2.咸阳市中心医院泌尿外科,陕西咸阳712000)摘要:目的基于生物信息学方法探究正常前列腺和前列腺癌(PCa)组织中的差异表达基因,筛选出可能作为PCa潜在生物标志物的基因,为后期临床医学提供科学依据。方法从GEO数据库下载GSE55945、GSE46602和GSE69223三个基因芯片数据集,通过联川生物云平台筛选差异表达基因(DEGs),使用STRING构建DEGs的蛋白质-蛋白质互作网络(PPI),导入Cytoscape后利用CytoHubba插件筛选MCC评分前30位的基因作为关键基因(Hub基因),利用DAVID对关键基因进行GO和KEGG富集分析,采用GraphPadPrism软件绘制ROC曲线,利用GEPIA数据库对关键基因进行验证,并进一步进行生存分析,利用UALCAN验证关键基因的表达与PCaGleason分级是否有相关性。结果GSE55945、GSE46602和GSE69223三个数据集分别得到428、727和1285个差异表达基因。韦恩(Venn)图显示三个数据集中包含的DEGs有105个。105个DEGs对应的PPI网络中筛选MCC评分排名前30位的基因作为Hub基因,其所涉及的生物过程主要包括蛋白激酶B信号的正向调节、细胞分化、转录的正调控、转化生长因子β受体信号通路负调控、细胞迁移的正向调节等,所涉及的通路为粘着斑、雌激素信号通路等。ROC曲线结果显示CAV1、KDR、CAV2、TGFBR1、SLC7A11、GSTM2、GSTM3、GSTM5、MYO6共9个基因同时在3个数据集中的诊断能力有统计学意义。9个Hub基因通过GEPIA网站验证显示,其中CAV1、KDR、CAV2、TGFBR1、GSTM2、GSTM3、GSTM5在PCa中呈低表达,而SLC7A11、MYO6在PCa中呈高表达,生存分析...

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