VDR基因FokI位点多态...核易感性关系的Meta分析_王清.pdf

河南预防医学杂志2023 年 2 月第 34 卷第 2 期Henan J Prev Med，Feb.2023，Vol.34,No.2VDR 基因 FokI 位点多态性与肺结核易感性关系的 Meta 分析王清1，文飞2，李斌11.青海大学医学院公共卫生系，青海 西宁 810008；2.西宁市第一人民医院摘要：目的应用 Meta 分析探讨 VDR 基因 FokI 位点多态性与肺结核易感性的关系。方法计算机检索英文数据库PubMed、中国知网（CNKI）、万方数据库（WanFang Data）等，查找从建库至 2021 年 12 月 31 日公开发表的所有国内外关于研究 VDR 基因 FokI 位点多态性与肺结核易感性关系的相关文献，加之采取文献追溯的方法，逐个检索相关的参考文献。由两名评价员根据纳排标准对文献进行筛选，提取数据并评价文献资料，利用 R 软件进行 Meta 分析。结果共纳入 34 篇相关文献，涉及 8 579 名病例组肺结核患者和 9 027 名对照人群。VDR FokI 多态性与肺结核之间的易感性在等位基因模型f vs F：OR(95%CI)：1.28（1.111.46），P0.01、显性基因模型ff+Ff vs FF：OR(95%CI)：1.23（1.111.36），P0.01、隐性基因模型ff vs FF+Ff：OR(95%CI)：1.36（1.151.60），P0.01、共显性基因模型ff vs FF：OR(95%CI)：1.52（1.221.90），P0.01；Ff vs FF：OR(95%CI)：1.20（1.051.36），P0.01中均具有统计学意义；在超显性基因模型ff+FF vsFf：OR(95%CI)：0.94（0.851.04），P=0.22中无统计学意义。结论全体人群、东亚人群 VDR 基因 FokI 位点多态性与结核易感性有关，f 等位基因可能是结核感染的危险因素。关键词：Meta 分析；肺结核；VDR；FokI；基因多态性中图分类号：R521文献标识码：B文章编号：1006-8414(2023)02-0133-10Meta analysis of the relationship between FokI polymorphism of VDRgene and susceptibility to tuberculosisWANG Qing1,WEN Fei2,LI Bin11.Public Health Faculty,Medical College,Qinghai University,Xining 810008,China;2.Xining First Peoples HospitalCorresponding author:LI Bin,E-mail:Abstract:Objective To explore the relationship between FokI polymorphism of VDR gene and susceptibility to pulmonarytuberculosis by meta-analysis.Methods By computer,English databases PubMed,CNKI,Wanfang Data,etc,were searched forall published papers on the relationship between VDR gene FokI polymorphism and susceptibility to tuberculosis published fromthe establishment of the databases to December 31,2021,and the method of literature tracing was adopted to retrieve therelevant references one by one.Two evaluators screened the literature according to the inclusion and exclusion criteria,extractedthe data and evaluated the literature,and conducted meta-analysis with R software.Results A total of 34 papers were included,involving 8 579 case group of TB patients and 9 027 control subjects.The correlation between VDR FokI polymorphism andtuberculosis was in the allele model f vs F:OR(95%CI):1.28(1.11-1.46),P0.01,dominant gene model ff+Ff vs FF:OR(95%CI):1.23(1.11-1.36),P0.01,recessive gene model ff vs FF+Ff:OR(95%CI):1.36(1.15-1.60),P0.01,co dominant genemodel ff vs FF:OR(95%CI):1.52(1.22-1.90),P0.01;Ff vs FF:OR(95%CI):1.20(1.05-1.36),P0.05），合并分析采用固定效应模型进行分析；若纳入的研究相互之间的同质性较差（即 I250或 P0.05），则合并分析采用随机效应模型进行分析。依据文献报道 VDR 基因 FokI 位点等位基因和基因型表达和分布情况计算合并 OR 值(95%CI)4。检验水准=0.05。2结果2.1文献检索结果根据中英文检索词在 PubMed、中国知网（CNKI）、万方数据库（WanFang Data）等数据库共检索到中英文 409 篇。初步排除文献 51 篇，阅读标题和摘要排除文献 286 篇，剩余的 72 篇文献经仔细阅读全文，最终纳入文献 34 篇（包括中文文献20 篇，英文文献 14 篇，共包含肺结核病人 8 579 例，健康对照人群 9 027 例）。在本文纳入的 34 个病例对照研究中，关于东亚人群报道 23 篇，南亚人群报道 5篇，西亚人群报道 3 篇，东南亚人群报道 1 篇，非洲人群报道 1 篇，北美洲人群报道 1 篇。纳入文献流程图见图 1。纳入研究的基本信息见表 1。2.2Meta 分析结果研究人群中 VDR FokI 多态性与结核关系的 Meta 分析本研究纳入的 34 项研究中，经异质性检测，各个研究间的等位基因模型、显性模134 河南预防医学杂志2023 年 2 月第 34 卷第 2 期Henan J Prev Med，Feb.2023，Vol.34,No.2表 2FokI 基因多态性与肺结核易感性的亚组分析结果基因模型分组OR 值(95%CI)P 值等位基因模型(f vs F)东亚1.25(1.061.48)0.01南亚1.26(0.821.94)0.30西亚1.31(0.792.17)0.30合计1.28(1.111.46)0.01显性基因模型(ff+Ff vs FF)东亚1.22(1.091.37)0.01南亚1.36(1.151.62)0.01西亚1.30(1.001.68)0.05合计1.23(1.121.36)0.01隐性基因模型(ff vs FF+Ff)东亚1.33(1.121.57)0.01南亚1.67(0.466.05)0.43西亚1.52(0.812.83)0.19合计1.35(1.151.59)0.01共显性基因模型(ff vs FF)东亚1.50(1.171.94)0.01南亚1.81(0.635.15)0.29西亚1.63(0.863.09)0.14合计1.52(1.221.90)0.01共显性基因模型(Ff vs FF)东亚1.16(1.011.33)0.04南亚1.17(0.721.92)0.52西亚1.24(0.712.15)0.45合计1.20(1.061.36)0.01超显性基因模型(ff+FF vs Ff)东亚1.01(0.951.08)0.69南亚0.92(0.531.61)0.77西亚0.86(0.501.46)0.57合计0.94(0.851.04)0.22型、隐形模型、共显性模型以及超显性模型统计学异质性均较大，故采用随机效应模型分析。2.2.1等位基因模型 Meta 分析结果VDR FokI 多态性与肺结核之间的相关性在等位基因模型 f vs F：OR（95%CI）：1.28（1.111.46），P0.01中具有统计学意义。见图 2。2.2.2各种基因型 Meta 分析结果VDR FokI 多态性与肺结核之间的相关性在显性基因模型 ff+Ff vsFF：OR（95%CI）：1.23（1.111.36），P0.01中具有统计学意义。见图 3。在隐性基因模型 ff vs FF+Ff：OR（95%CI）：1.36（1.151.60），P0.01中具有统计学意义。见图 4。在共显性基因模型ff vs FF：OR（95%CI）：1.52（1.221.90），P0.01；Ff vs FF：OR（95%CI）：1.20（1.051.36），P0.01中均具有统计学意义。见图 5-6。在超显性基因模型 ff+FF vs Ff：OR（95%CI）：0.94（0.851.04），P=0.22无统计学意义。见图 7。2.2.3亚组分析结果研究人群中 VDR FokI 多态性与结核关系的亚组分析中，经异质性检验，东亚人群在等位基因模型、显性模型、隐形模型、共显性模型中异质性较大，采用随机效应模型，超显性模型异质性较小，采用固定效应模型；南亚人群在等位基因模型、隐形模型、共显性模型、超显性模型中异质性较大，采用随机效应模型，显性模型异质性较小，采用固定效应模型；西亚人群在等位基因模型、共显性模型（Ff vsFF）、超显性模型中异质性较大，采用随机效应模型，显性模型、隐性模型、共显性模型（ff vs FF）异质性较小，采用固定效应模型。根据不同种族进行亚组分析，在东亚人群中除了超显性基因模型其他模型中均有统计学意义 f vs F：OR（95%CI）：1.25（1.061.48），P0.01；ff+Ff vs FF：OR（95%CI）：1.22（1.091.37），P0.01；ff vs FF+Ff：OR（95%CI）：1.33（1.121.57），P0.01；ff vs FF：OR（95%CI）：1.50（1.171.94），P0.01；Ff vs FF：OR（95%CI）：1.16（1.011.33），P=0.04；在南亚、西亚人群中只有显性基因模型有统计学意义 ff+Ff vs FF：OR（95%CI）：1.36（1.151.62），P0.01；ff+Ff vs FF：OR（95%CI）：1.30（1.001.68），P=0.05。见表 2。图 1纳入文献流程图135 河南预防医学杂志2023 年 2 月第 34 卷第 2 期Henan J Prev Med，Feb.2023，Vol.34,No.2表 3各研究的发表偏倚评估分类Begger sZ 值P 值等位基因模型0.190.847 2显性基因模型0.520.603 9隐形基因模型0.790.432 0共显性基因模型(ff vs FF)0.340.733 1共显性基因模型(Ff vs FF)0.400.689 0超显性基因模型-0.130.893 9表 1纳入研究基本信息表第一作者年份国家洲别HWE基因检测方法对照来源NOS评分Liu Wei52003 ChinaEast AsiaYPCR-RFLP无血缘关系的健康参与者（军人）8Liu Wei62003 ChinaEast