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基于CNN双路特征融合模型的秀丽隐杆线虫寿命阶段分类研究.pdfVIP免费

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2023年第5期计算机与数字工程收稿日期:2022年11月4日,修回日期:2022年12月20日作者简介:尹彦豪,男,硕士研究生,研究方向:图像处理。刘俊,男,博士,教授,研究方向:图像处理、医学图像分析、机器学习等。杨烨,男,博士研究生,研究方向:细胞生理学。∗1引言秀丽隐杆线虫是生物学研究中最重要的无脊椎模式生物之一,有着生命周期较短、生理结构简单、与人类基因高度同源、虫体透明便于观察等特点,从19世纪70年代初开始,就作为功能强大的模式生物被广泛应用[1]。它的研究跨越了多个学科领域,包括基因大规模功能与表征研究[2],全身细基于CNN双路特征融合模型的秀丽隐杆线虫寿命阶段分类研究∗尹彦豪1,2刘俊1,2杨烨3(1.武汉科技大学计算机科学与技术学院武汉430065)(2.智能信息处理与实时工业系统湖北省重点实验室武汉430065)(3.华中科技大学生命科学与技术学院武汉430074)摘要秀丽隐杆线虫(C.elegans)由于其有着寿命较短和人类基因高度同源的特点,作为一种被优秀的模式生物,被广泛应用于多种人类健康和疾病模型的研究中。为了准确测定当前线虫所处于的寿命阶段,论文提出了一种基于CNN双路特征融合模型的的秀丽隐杆线虫寿命阶段分类方法。首先,利用卷积神经网络分类模型对线虫图像进行特征提取;同时使用快速傅里叶变换、LoG算子等图像处理算法得到荧光蛋白亮斑坐标,然后根据坐标信息计算得到荧光蛋白亮斑聚集度信息;最后,将前两步得到的特征拼接通过分类器得到分类结果。实验结果表明,论文方法能够准确、有效地对线虫寿命阶段进行分类。关键词秀丽隐杆线虫;图像分类;深度学习;快速傅里叶变换;拉普拉斯-高斯算法中图分类号TP391DOI:10.3969/j.issn.1672-9722.2023.05.033ResearchonClassificationofCaenorhabditisElegansLifeStageBasedonCNNDual-PathFeatureFusionYINYanhao1,2LIUJun1,2YANGYe3(1.CollegeofComputerScienceandTechnology,WuhanUniversityofScienceandTechnology,Wuhan430065)(2.HubeiProvinceKeyLaboratoryofIntelligentInformationProcessingandReal-timeIndustrialSystem,Wuhan430065)(3.CollegeofLifeScienceandTechnology,HuazhongUniversityofScienceandTechnology,Wuhan430074)AbstractAsanexcellentmodelorganism,C.eleganshasbeenwidelyusedinmanyhumanhealthanddiseaseresearchesduetoitsshortlifespanandhighhomologywithhumangenes.Inordertoaccuratelydetermine...

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