·研究报告·生物技术通报BIOTECHNOLOGYBULLETIN2023,39(6):248-258收稿日期:2022-09-16基金项目:中国烟草总公司河南省公司重点项目(2021410000240021),中国烟草总公司浙江工业有限公司(ZJZY2021B009),福建烟草总公司南平市公司(2021350700240072,NYK2022-04-03),贵州烟草总公司贵阳公司(2020-07),湖南烟草总公司长沙市公司(21-23A04),贵州烟草总公司铜仁市公司(202101)作者简介:张路阳,男,硕士研究生,研究方向:烟草育种;E-mail:zhangluyang97@126.com通讯作者:张智强,男,博士,讲师,研究方向:烟草育种;E-mail:xiao_qiang8866@163.com烟草TCP基因家族的鉴定及表达分析张路阳1韩文龙1徐晓雯2姚健2李芳芳3田效园3张智强1(1.河南农业大学烟草学院,郑州450002;2.河南省烟草公司许昌市公司,许昌461000;3.中国烟草总公司河南省公司,郑州450002)摘要:TCP基因是植物特有的转录因子,对植物的生长发育起到重要的作用。鉴定烟草TCP基因家族,为烟草TCP基因功能研究及遗传改良提供理论依据。基于烟草全基因组数据,通过BLAST对烟草TCP基因家族进行鉴定,利用生物信息学的方法分析了该家族成员的理化性质、基因结构、蛋白质结构域、染色体分布、系统进化及启动子分析,并利用RT-qPCR验证了TCP基因家族在烤烟不同品种各个组织的表达情况。烟草中共鉴定了20个TCP基因,将其分为两大类ClassI与ClassII;已知的TCP基因位于不同的染色体上且分布不均匀,所有TCP基因均具有保守的结构域;TCP基因家族启动子区域显著富集生长发育和激素响应的顺式元件,部分TCP基因还具有低温胁迫的作用元件;20个NtTCPs基因在K326和Ti706不同组织和不同时期叶片内存在不同程度的表达,NtTCPs基因在烟草K326和Ti706中的表达具有组织特异性。其中ClassI亚族基因在6个组织和苗期叶片内表达水平较高,而ClassII亚族基因在幼苗叶片、上部叶和中部叶表达水平较高。研究结果揭示了烟草TCP基因家族成员在烟草生长发育过程中起到重要作用,为探究烟草TCP基因家族的生物学功能提供了基础。关键词:烟草;TCP基因;全基因组鉴定;生物信息学;组织差异;表达模式分析;荧光定量PCRDOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2022-1141IdentificationandExpressionAnalysisoftheTobaccoTCPGeneFamilyZHANGLu-yang1HANWen-long1XUXiao-wen2YAOJian2LIFang-fang3TIANXiao-yuan3ZHANGZhi-qiang1(1.TobaccoCollege,HenanAgriculturalUniversity,Zhengzhou450002...