RGS2在泛癌中诊断、预后和免疫浸润的分析洪健豪,张亭,杨骏,谢诗恩,易晨,江少锋(南昌航空大学测试与光电工程学院,南昌330063)[摘要]为探究G蛋白信号调节蛋白2(RegulatorofGProteinSignaling2,RGS2)在泛癌中的表达与预后和免疫浸润的关系,利用生物信息学方法、结合R语言与多个数据库进行了深入分析。首先,通过TCGA数据库分析RGS2在33种癌症肿瘤组织与正常组织中的差异表达,并通过GEO数据库对部分结果进行验证;再通过Cox回归分析与log-rank检验进行预后分析。接着进行免疫浸润分析,并通过ssGSEA分析RGS2对免疫微环境的影响;根据RGS2表达的高低分组获取差异基因,并通过GeneOntology(GO)、KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes(KEGG)富集分析找到与RGS2相关的分子通路。最后,通过STRING数据库、GENEMANIA数据库获取RGS2的相关基因,搭建蛋白互作网络(Protein-ProteinInteractionNetworks,PPI)。结果表明,RGS2表达量在24种癌症肿瘤组织显著下调,在4种癌症中显著上调。RGS2在膀胱尿路上皮癌、肾透明细胞癌、肝细胞肝癌、胃腺癌中为危险因素,但在皮肤黑色素瘤、子宫癌肉瘤为保护因素。免疫浸润分析结果表明,RGS2表达与多数免疫细胞表达量显著正相关,但与Th17细胞表达量显著负相关。富集分析表明,RGS2与补体活化、免疫球蛋白受体结合等功能和通路密切相关。PPI蛋白互作网络显示RGS2与RGS4、GNA11、GNA14等基因具有显著相关性。综上所述,RGS2在28种癌症中显著差异表达,可作6种癌症的独立预后因子,与多种癌症的免疫浸润水平显著相关。因此,RGS2有望成为多种癌症的诊断、预后、免疫浸润的新型生物标志物,有望成为一种新的治疗靶点。[关键词]泛癌;RGS2;诊断;预后;免疫浸润[中图分类号]Q811.4[文献标志码]Adoi:10.3969/j.issn.2096-8566.2023.02.010[文章编号]2096-8566(2023)02-0078-11Pan-cancerAnalysisofRGS2GeneinDiagnosis,PrognosisandImmuneInfiltrationHONGJian-hao,ZHANGTing,YANGJun,XIEShi-en,YIChen,JIANGShao-feng(SchoolofTestingandOptoelectronicEngineering,NanchangHangkongUniversity,Nanchang330063,China)Abstract:ThisstudyaimstoinvestigatetherelationshipbetweenRGS2expression,prognosis,andimmuneinfiltrationinpan-cancerbyusingbioinformaticsanalysismethodsbasedonRandvariousdatabases.Firstly,thedifferentialexpressionofRGS2in33differenttumorandnormaltissueswasanalyzedbasedonthe...