收稿日期２０２２－０９－０２第一作者简介吴毓敏ꎬ女ꎬ住院医师ꎬ主要从事冠心病、心力衰竭、心律失常等研究ꎮ∗通信作者张长江ꎬ医学博士ꎬ教授ꎬ硕士生导师ꎬ主要从事介入心脏病学、心律失常ꎬ心电生理等研究ꎮ成人爆发性心肌炎相关ｍｉＲＮＡ的生物信息学分析吴毓敏ꎬ向杰ꎬ周科ꎬ张长江∗湖北民族大学附属民大医院(湖北恩施４４５０００)【摘要】目的通过生物信息学方法寻找成人爆发性心肌炎中的差异表达ｍｉＲＮＡ、关键靶基因和通路ꎬ为成人爆发性心肌炎的预防和早期诊断及治疗提供新思路ꎮ方法从公共基因数据库(ＧＥＯ)中下载ｍｉＲＮＡ表达谱ＧＳＥ１４８１５３ꎬ使用在线分析工具ＧＥＯ２Ｒ筛选出成人爆发性心肌炎患者血清和正常对照者血清的差异表达ｍｉＲＮＡꎬ并利用在线数据库ＴａｒｇｅｔＳｃａｎ预测差异表达ｍｉＲＮＡ的靶基因ꎮ使用ＤＡＶＩＤ和ＳＴＲＩＮＧ分别对靶基因进行功能、通路富集分析和蛋白互作分析ꎬ使用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ软件来筛选蛋白相互作用网络中的核心网络基因及显著相互作用模块ꎮ结果共筛选出３１个差异表达ｍｉＲＮＡꎬ其中下调ｍｉＲＮＡ１８个ꎬ上调ｍｉＲＮＡ１３个(调整后Ｐ<０.０５ꎬｌｏｇＦＣ>１)ꎮ使用ＴａｒｇｅｔＳｃａｎ预测ｍｉＲＮＡ的靶基因ꎬ按照ｃｏｎｔｅｘｔ＋＋得分各取前５０个靶基因进行分析ꎬ故上调ｍｉＲＮＡ靶基因为６４３个ꎬ下调ｍｉＲＮＡ靶基因８７９个(剔除无注释的基因)ꎮ对靶基因进行ＧＯ和ＫＥＧＧ富集分析ꎬ上调ｍｉＲＮＡ靶基因ＧＯ分析结果提示:生物过程:ｍｉＲＮＡ靶基因显著富集于以ＤＮＡ为模板的转录调控、ＤＮＡ模板转录、ＲＮＡ聚合酶ＩＩ启动子的转录等ꎻ细胞单位:ｍｉＲＮＡ靶基因显著富集于胞内、肌动蛋白丝等ꎻ分子功能:ｍｉＲＮＡ靶基因显著富集于核酸结合、金属离子结合、ＤＮＡ结合等ꎮ下调ｍｉＲＮＡ靶基因ＧＯ分析(Ｐ<００５)结果提示:生物过程:ｍｉＲＮＡ靶基因显著富集于聚合酶ＩＩ启动子转录的调控、ＢＭＰ信号通路的负调控、凋亡过程等ꎻ细胞单位:ｍｉＲＮＡ靶基因显著富集于细胞质、核等ꎻ分子功能:ｍｉＲＮＡ靶基因显著富集于氯离子通道复合物、蛋白质结合、序列特异性ＤＮＡ结合等ꎮ上调ｍｉＲＮＡ靶基因ＫＥＧＧ富集分析结果提示ｍｉＲＮＡ靶基因显著富集于逆行内源性大麻素信号、ＧＡＢＡ能突触、Ｒａｓ信号通路等ꎻ下调ｍｉＲＮＡ靶基因ＫＥＧＧ富集分析结果提示ｍｉＲＮＡ靶基因显著富集于ＦｏｘＯ信号通路、ｍＴＯＲ信号通路等(Ｐ<０...
