曲霉科五个中国新记录种_刘畅.pdf

Short communication 简报 22 March 2023,42(3):835-848 菌物学报 Mycosystema ISSN1672-6472 CN11-5180/Q Doi:10.13346/j.mycosystema.220206 资助项目：国家自然科学基金(31870012,31750001)；科技部基础资源调查专项(2019FY100700)；中国科学院前沿科学重点研究项目(QYZDY-SSW-SMC029)This work was supported by the National Natural Science Foundation of China(31870012,31750001),the National Project on Scientific Groundwork,Ministry of Science and Technology of China(2019FY100700),and the Key Research Program of Frontier Science,Chinese Academy of Sciences(QYZDY-SSW-SMC029).*Corresponding author.E-mail: ORCID:LIU Chang(0000-0001-5869-6264),ZENG Zhaoqing(0000-0002-8460-7824)Received:2022-06-06;Accepted:2022-06-20 Copyright 2023 Institute of Microbiology,CAS.All rights reserved.| Http:/journals- Tel:+86-10-64807521 菌物学报 835 曲霉科五个中国新记录种 刘畅1,2，庄文颖1，余知和2，曾昭清1,2*1 中国科学院微生物研究所 真菌学国家重点实验室，北京 100101 2 长江大学生命科学学院，湖北 荆州 434025 摘 要：对分离自海南和辽宁滩涂沉积物中的曲霉属和青霉属菌株进行系统分类研究，报道 5 个中国新记录种：假溜曲霉 Aspergillus pseudotamarii、乌尔米曲霉 A.urmiensis、南极青霉 Penicillium antarcticum、荒漠青霉 P.desertorum 和拉布拉多青霉 P.labradorum，并提供了上述物种的形态特征描述及图示。同时，联合 BenA 和 CaM 基因序列进行系统发育分析，为形态学鉴定提供了佐证。研究结果丰富了我国该类真菌的物种多样性。关键词：青霉属；曲霉属；多相分类学；-微管蛋白；钙调蛋白；滩涂沉积物 引用本文 刘畅，庄文颖，余知和，曾昭清，2023.曲霉科五个中国新记录种.菌物学报，42(3):835-848 Liu C,Zhuang WY,Yu ZH,Zeng ZQ,2023.Five new records of Aspergillaceae(Ascomycota,Eurotiales)in China.Mycosystema,42(3):835-848 Five new records of Aspergillaceae(Ascomycota,Eurotiales)in China LIU Chang1,2,ZHUANG Wenying1,YU Zhihe2,ZENG Zhaoqing1,2*1 State Key Laboratory of Mycology,Institute of Microbiology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100101,China 2 College of Life Sciences,Yangtze University,Jingzhou 434025,Hubei,China Abstract:Strains of Aspergillus and Penicillium isolated from tidal flat sediments in the provinces of Hainan and Liaoning were examined.Five species,namely,Aspergillus pseudotamarii,A.urmiensis,Penicillium antarcticum,P.desertorum and P.labradorum,are encountered and new to China.Their morphological descriptions and illustrations are provided 刘畅 等/曲霉科五个中国新记录种 简报 菌物学报 836 based on observations of these strains.The taxonomic positions are confirmed by sequence analyses of the combined-tubulin(BenA)and calmodulin(CaM)genes.The results enriched the species diversity of Aspergillaceae in China.Keywords:Aspergillus;Penicillium;polyphasic taxonomy;BenA;CaM;tidal flat sediments 曲霉科Aspergillaceae建立于1826年，主要包括曲霉属 Aspergillus P.Micheli 和青霉属Penicillium Link 等 15 个属(Houbraken et al.2020)。其中，曲霉属和青霉属物种分布广泛(Houbraken et al.2020；Wang&Zhuang 2022)，许多种类与人类生活密切相关。如烟曲霉 A.fumigatus Fresen.和黄曲霉 A.flavus Link 是重要的致病菌，可侵染植物导致霉变和腐烂，也能感染人和畜禽(Frisvad&Larsen 2015；Solairaj et al.2020)；米曲霉 A.oryzae(Ahlb.)Cohn 和酱油曲霉 A.sojae Sakag.&K.Yamada ex Murak.常用于酿造(Sardjono et al.1998；Kim et al.2017)；产黄青霉 P.chrysogenum Thom 和灰黄青霉 P.griseofulvum Dierckx 等可产生抗生素及真菌毒素(Frisvad et al.2004；Kuncic et al.2012)；草酸青霉 P.oxalicum Currie&Thom 和橘灰青霉P.aurantiogriseum Dierckx等具生防潜力(Zhao et al.2021；Yang et al.2022)。由于上述二属具较高的物种多样性，建立了属下分类系统(Samson et al.2014；Visagie et al.2014)。最新研究表明，曲霉属包括 27 个组(section)470 余种(Houbraken et al.2020；Wang&Zhuang 2022)。青霉属共 32 个组 500 余种(Labuda et al.2021；Liang et al.2021；Rodrguez-Andrade et al.2021；Visagie et al.2021；Torres-Garcia et al.2022)。本研究报道分离自我国海南和辽宁沿海滩涂沉积物中的曲霉属 Flavi 组和 Flavipedes组、青霉属 Canescentia 组、Chrysogena 组和Exilicaulis 组 5 个中国新记录种，即假溜曲霉 A.pseudotamarii Yoko Ito,et al.、乌尔米曲霉 A.urmiensis Arzanlou,Houbraken&Samadi、南极青霉 P.antarcticum A.D.Hocking&C.F.McRae、荒漠青霉 P.desertorum Frisvad,Houbraken&Samson 和拉布拉多青霉 P.labradorum Gibas,et al.。研究结果丰富了我国该类真菌的物种多样性。1 材料与方法材料与方法 1.1 样品采集和菌株分离 沉积物样品采集自我国海南和辽宁的沿海滩涂，采用梯度稀释平板法(孟庆恒等 2007)和颗粒平板法(马艺源等 2020)进行真菌分离。分离菌株用培养基包括海水马铃薯葡萄糖培养基(sea salts-potato dextrose agar,ss-PDA)、海水麦芽浸膏培养基(sea salts-malt extract agar,ss-MEA)和海水合成低营养琼脂(sea salts-synthetic low nutrient agar,ss-SNA)(周静等 2012)(海盐 3%)。分离培养物和干标本分别保藏于中国 普 通微生物菌种保藏中心(China General Microbiological Culture Collection Center,CGMCC)和中国科学院微生物研究所菌物标本馆(Herbarium Mycologicum Academiae Sinicae,HMAS)。1.2 形态学研究 菌落形态观察使用查氏酵母精琼脂(Czapek yeast autolysate agar,CYA)、麦芽精琼脂(malt extract agar,MEA)、马铃薯葡萄糖培养基(potato dextrose agar,PDA)和酵母膏蔗糖琼脂(yeast extract sucrose agar,YES)(Frisvad 1981；Samson et al.2010)。接种方法、培养条件和显微结构观察、测量及形态描述参考 Samson et al.(2014)和 Visagie et al.(2014)的方法。1.3 基因组 DNA 提取、PCR 扩增及序列测定 菌株 DNA 提取参考 Liu et al.(2022)的方法。PCR 扩增片段包括微管蛋白基因(-tubulin Short communication 22 March 2023,42(3):835-848 Mycosystema ISSN1672-6472 CN11-5180/Q 菌物学报 837 gene,BenA,约 400 bp)、钙调蛋白基因(calmodulin gene,CaM,约 500 bp)和核糖体 DNA 内转录间隔区 1,2 和 5.8S 序列(nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer 1-5.8S-internal transcribed spacer 2 sequence,rDNA ITS1-5.8S-ITS2,ITS,约600 bp)，扩增引物见表1，扩增条件参照表1所列文献。PCR 产物送北京诺赛基因组研究中心有限公司纯化并进行双向测序。1.4 系统发育分析 所获得的原始序列及网上下载的相关序列(表 2)通过 BioEdit 7.0.5(Hall 1999)进行比对，去除引物序列后进行拼接。生成的 FASTA 文件使用 ClustalX 2.1 转换为 nexus 文件(Thompson et al.1997)。分别采用最大似然法(maximum likelihood,ML)和贝叶斯法(Bayesian inference,BI)进行系统发育分析。ML 分析使用默认 GTRCAT模型通过 RaxML(Stamatakis 2006)进行，采用随机增加分类群的方法计算最大简约支持率(maximum likelihood bootstrap support,MLBS)。BI 分析使用 MrBayes v.3.2.5(Ronquist e