第33卷第1期2023年2月生物技术Biotechnology33(1):33Feb.,2023收稿日期:2022-03-31基金资助:国家自然科学基金项目(62161009)作者简介:窦承贤(1997-),男,硕士研究生,研究方向:生物信息学,E-mail:douchengxian1997@163.com。∗通讯作者:梁晋涛(1970-),男,博士,教授,研究方向:生物医学信息研究,发表论文30篇,授权专利5项,E-mail:dxljt@guet.edu.cn。李桂银(1972-),女,博士,教授,研究方向:生物医学信息研究,SCI收录论文40多篇,申请发明专利38项,获授权16项,E-mail:liguiyin01@guet.edu.cn。铁蛋白结构和功能的生物信息学分析窦承贤1,方敏全1,梁晋涛1∗,李桂银1,2∗(1.桂林电子科技大学生命与环境科学学院,广西桂林541004;2.广东石油化工学院化学学院,广东茂名525000)摘要:[目的]通过生物信息学方法探究铁蛋白的结构和功能的相关信息,研究铁蛋白与肝癌的潜在关系。[方法]从NCBI获取铁蛋白序列,分别使用ProScale、TMHMM、NCBI-CDD和Prosite工具分析铁蛋白的亲疏水性、跨膜区、功能结构域和生物活性位点。使用SOPMA、PSIPRED和SWISS-MODEL平台预测了铁蛋白的二级结构和三级结构。进一步,基于STRING数据库研究了铁蛋白的互作蛋白和富集通路。[结果]铁蛋白是一种亲水性蛋白,无跨膜区,存在1个铁蛋白样二铁氧化的功能结构域和2个生物活性位点,具有较高的螺旋程度。铁蛋白与RPS17、TFRC、SCARA5、NCOA4和COX8A五种蛋白相互作用,这些蛋白显著富集在铁死亡与矿物吸收富集途径,与癌症的发生有关。[结论]对铁蛋白进行生物信息学分析,预测了铁蛋白重链和轻链的理化性质和空间结构,也从其功能上揭示了与肝癌的潜在关系,为深入研究提供了理论基础。关键词:铁蛋白;重链;轻链;肝癌;互作蛋白;铁死亡中图分类号:Q71文献标识码:ADOI:10.16519/j.cnki.1004-311x.2023.01.0006BioinformaticsanalysisofthestructureandfunctionofferritinDOUCheng-xian1,FANGMin-quan1,LIANGJin-tao1∗,LIGui-yin1,2∗(1.SchoolofLifeandEnvironmentalSciences,GuilinUniversityofElectronicTechnology,Guilin541004,China;2.CollegeofChemistry,GuangdongUniversityofPetrochemicalTechnology,Maoming525000,China)Abstract:[Objective]Throughbioinformaticsmethodstoexploretherelevantinformationofthestructureandfunctionoffer-ritin,andstudiedthepotentialrelationshipbetweenferritinandlivercancer.[Method]TheaminoacidsequenceofferritinwasobtainedfromNCBI.Thehydrophilicity,tr...
