第49卷第2期2023年3月吉林大学学报(医学版)JournalofJilinUniversity(MedicineEdition)Vol.49No.2Mar.2023DOI:10.13481/j.1671⁃587X.20230221六价铬致肝脏损伤作用机制的生物信息学分析王睿1,章鼎2,诸葛瑞剑1,薛倩1,郭丽1(1.吉林大学公共卫生学院卫生毒理学教研室,吉林长春130021;2.吉林大学中日联谊医院脊柱外科,吉林长春130033)[摘要]目的目的:通过生物信息学方法识别六价铬[Cr(Ⅵ)]致肝脏损伤的相关基因,为探讨Cr(Ⅵ)致机体肝脏损伤作用机制的研究提供新的方向。方法方法:检索基因表达综合(GEO)数据库中与“[Cr(Ⅵ)]liver”相关数据集,下载数据集GSE65198,通过limma包筛选差异表达基因(DEGs),并进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用String数据库进行蛋白-蛋白互作(PPI)网络分析,Cytohubba插件筛选hub基因,通过Enrichr网站使用药物特征数据库预测靶向药物分子。结果结果:选择数据集GSE65198中的样本20例,分为2组。第1组20mg·kg-1Cr(Ⅵ)1次暴露后1d肝脏样本和对照样本各5例;第2组20mg·kg-1Cr(Ⅵ)1次暴露后7d肝脏样本和对照样本各5例,以每组的对照样本作为阴性对照分别筛选得到342个和61个DEGs(|Log2FC|>1和P<0.05)。GO富集分析,DEGs主要富集于对药品反应、有丝细胞分裂和衰老等生物学过程;KEGG分析,主要信号通路包括核糖体生物发生、细胞周期调节和p53信号通路等。PPI网络中hub基因分析,1次暴露后1d组样本的EBNA1结合蛋白2(EBNA1BP2)、核仁蛋白58(NOP58)、鸟嘌呤核苷酸结合蛋白样3(GNL3)、核仁蛋白56(NOP56)和WD重复域12(WDR12)及1次暴露后7d组样本的细胞周期蛋白B2(CCNB2)(在PPI网络中标识符为ENSRNOP00000017117)、细胞周期蛋白A2(CCNA2)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)和驱动蛋白家族成员20B(KIF20B)被筛选为hub基因。靶向药物预测,罗斯科维汀等药物被认定为Cr(Ⅵ)致机体肝脏损伤的靶向药物。结论结论:Cr(Ⅵ)致肝脏损伤的作用机制可能与细胞周期相关基因有关,罗斯科维汀可能是其潜在的临床治疗药物。[关键词]六价铬;肝脏;生物信息学;差异表达基因;损伤[中图分类号]R114[文献标志码]ABioinformaticsanalysisonmechanismofliverinjuryinducedbyhexavalentchromiumWANGRui1,ZHANGDing2,ZHUGERuijian1,XUEQian1,GUOLi1(1.DepartmentofToxicology,SchoolofPublicHealth,Jil...