3期·657·雌雄罗氏沼虾脑和胸神经节的转录组比较分析张雨阳1，赵莉1，桂朗1，王余德2，孙盛明3，李名友1，刘东1，4*（1农业农村部稻渔综合种养生态重点实验室（上海海洋大学），上海201306；2湖南师范大学生命科学学院/省部共建淡水鱼类发育生物学国家重点实验室，湖南长沙410081；3水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室（上海海洋大学），上海201306；4海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室（上海海洋大学），上海201306）摘要：【目的】基于转录组测序技术筛选出罗氏沼虾（Macrobrachiumrosenbergii）雌雄样本脑和胸神经组织中的差异表达基因（DEGs），为揭示其生长发育的性别二态性及开展分子辅助育种提供理论依据。【方法】通过TRIzol提取罗氏沼虾雌雄样本脑和胸神经节组织总RNA，构建cDNA测序文库后通过IlluminaHiSeq2000平台进行转录组测序，经过滤、质量控制及拼接组装获得Unigenes，使用DESeq筛选出DEGs，并进行GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析。【结果】转录组数据经denovo拼接成84627条Unigenes。以P<0.05和|log2FoldChange|>1为判断标准，发现雌雄罗氏沼虾脑组织间存在5287个DEGs，雄性组织中显著上调DEGs有2416个、显著下调DEGs有2871个；胸神经节组织间存在6211个差异表达基因，雄性组织中显著上调DEGs有3280个、显著下调DEGs有2931个。雌雄罗氏沼虾脑和胸神经节组织DEGs在GO数据库中注释到生物学过程、细胞组分和分子功能三大功能条目，分别涉及56和57个亚类，包含顶体外膜、生殖结构发育、组织形态发生、细胞过程、代谢过程、细胞组分及结合等；KEGG信号通路富集分析结果表明，DEGs主要参与RNA运输、剪接体、内质网蛋白加工、转录、翻译、折叠和降解等过程。筛选得到的TU-BA1B、COX、TRY、MHC、MLC、HSP90和IAGBP等10个DEGs与罗氏沼虾肌肉生长及性腺发育相关，对雌雄罗氏沼虾生长发育差异调控起重要作用。【结论】雌雄罗氏沼虾脑和胸神经节组织中的TUBA1B、COX、TRY、MHC、MLC、HSP90、TRA2、PCNA、MT-ND4和IAGBP等DEGs，富集在RNA转运、内质网蛋白加工及MAPK信号通路等，参与肌肉生长和性腺发育调控，有助于罗氏沼虾生长发育性别二态性的形成。关键词：罗氏沼虾；性别二态性；脑；胸神经节；转录组；差异表达基因（DEGs）中图分类号：S917文献标志码：A文章编号：2095-1191（2023）03-0657-12收稿日期：2022-09-18基金项目：上海市科技创新行动计划（国内科技合作）项目（21015801200）；省部共建淡水鱼类发育生物...
