安徽医药AnhuiMedicalandPharmaceuticalJournal2023Aug，27（8）基于坏死性凋亡相关长链非编码RNA构建肝细胞癌预后模型及药物治疗反应分析张玉俊1，朱琳2，赵璇1，地力亚尔·吾斯曼江1，王岩2作者单位：1新疆医科大学公共卫生学院，新疆维吾尔自治区乌鲁木齐830054；2新疆医科大学附属肿瘤医院，新疆维吾尔自治区乌鲁木齐830011通信作者：王岩，女，副教授，硕士生导师，研究方向为肿瘤流行病学，Email：xjwangyan2012@163.com基金项目：新疆维吾尔自治区自然科学基金项目（2021D01C379）；省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室开放课题项目（SKL-HIDCA-2020-ER3，SKL-HIDCA-2020-33）摘要：目的使用坏死性凋亡相关长链非编码RNA（NRLs）构建肝细胞癌（HCC）预后模型并分析不同风险组间药物敏感性差异，为HCC病人预后预测和临床个体化治疗提供理论依据。方法从癌症基因组图谱（TCGA）数据库中下载HCC病人的RNA测序数据和临床信息。采用共表达网络分析鉴定NRLs。使用单变量Cox回归和LASSO-Cox回归构建预后模型，并在测试集和整个集合中进行验证。运用生存分析、受试者操作特征（ROC）曲线、临床病理分层相关性分析、多变量Cox回归、列线图和校准曲线来评估预后模型。随后，采用基因集富集分析（GSEA）不同风险群体间生物过程和功能的差异。使用单样本基因集富集分析（ssGSEA）来探讨不同风险群体与肿瘤免疫、浸润之间的关系，并采用Pearson相关分析HCC病人预后特征与免疫检查点表达的相关性。最后，使用药物敏感性分析20种化疗药物在不同风险群体中的IC50值。结果构建了由4个NRLs（ZFPM2-AS1、MKLN1-AS、LINC01116、AP003390.1）组成的风险评分（NRLsrisk-Score）预后特征，并根据风险评分中位值将病人划分为高风险组和低风险组。生存分析表明，NRLs低风险组的总生存期（OS）显著高于高风险组；与临床病理特征相比，NRLsrisk-Score具有更高的诊断效率，受试者操作特征曲线下面积（AUC）为0.74；临床病理变量分层生存分析表明，高风险组病人OS显著低于低风险组；多变量Cox结果显示，分期（Stage）和NRLsrisk-Score可作为HCC病人的独立预后因子，结合临床病理学特征和NRLsrisk-Score的列线图显示出较好的预测性能。GSEA分析表明，癌症相关通路主要在高风险组中富集。ssGSEA结果显示，NRLs预测特征与HCC病人的免疫状态显著相关。免疫检查点分析结果显示，高风险组病人的免疫检查点表达较高，表明可能受益于检查点阻滞剂免疫疗法的高风险组HCC病...
