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单增李斯特菌前噬菌体的分布及遗传特征分析_纪顺师.pdfVIP免费

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*实验研究*单增李斯特菌前噬菌体的分布及遗传特征分析纪顺师1,王艳1,宋泽萱1,毛盼1,李玲玲1,陈晋妮1,刘凌云1,2,孙晖1,罗霞1,叶长芸1摘要:目的了解单增李斯特菌基因组中前噬菌体分布状况和基因组特征。方法自公共数据库GenBank获得275株单增李斯特菌的全基因组序列,运用前噬菌体在线预测软件(PHASTER)对其携带的前噬菌体进行预测。并对预测的完整前噬菌体进行聚类分析、插入位点识别、噬菌体整合酶多态性分析。此外,通过比对耐药基因和毒力基因数据库,搜寻前噬菌体可能携带的耐药基因和毒力基因。结果本研究发现99.3%的单增李斯特菌基因组含有前噬菌体序列,155株(56.4%)单增李斯特菌基因组预测到229个完整前噬菌体序列。所有完整前噬菌体聚集成4个群,进一步划分为10个簇。前噬菌体分群与其宿主菌所属家系具有较强的相关性,但与宿主菌来源无关。本研究识别到10个前噬菌体插入位点,其中lmot17(tRNAArg),lmot11(tRNASer)和comK是3个最常见的插入位点,lmo1263为新发现的插入位点。相同插入位点前噬菌体所携带整合酶氨基酸序列高度相似。此外,研究发现部分家系Ⅲ菌株和1株家系Ⅰ菌株的噬菌体中携带毒力相关蛋白E编码基因(virE),所有完整前噬菌体中未发现耐药基因。结论单增李斯特菌普遍携带前噬菌体,超过半数的菌株携带完整前噬菌体,其基因组具有多样性,且在宿主菌染色体中具有多个插入位点。这些插入位点与噬菌体所携带整合酶氨基酸序列密切相关。此外,未发现前噬菌体中携带耐药基因。关键词:单增李斯特菌;前噬菌体;插入位点;整合酶中图分类号:R211;R378文献标志码:A文章编号:1003−9961(2023)05−0529−08DistributionandgeneticcharacterizationofListeriamonocytogenesprophagesJiShunshi1,WangYan1,SongZexuan1,MaoPan1,LiLingling1,ChenJinni1,LiuLingyun1,2,SunHui1,LuoXia1,YeChangyun1.1.StateKeyLaboratoryofInfectiousDiseasePreventionandControl,NationalInstituteforCommunicableDiseaseControlandPrevention,ChineseCenterforDiseaseControlandPrevention,Beijing102206,China;2.DepartmentofMicrobiology,SchoolofBasicMedicine,GuizhouMedicalUniversity,KeyLaboratoryofPathogenicBiologyinGuizhouProvince,Guiyang550025,Guizhou,ChinaCorrespondingauthor:YeChangyun,Email:yechangyun@icdc.cnAbstract:ObjectiveThisstudyaimstoinvestigatethedistributionandgenomiccharacteristicsofthe...

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