·生物信息学·doi:10.3969/j.issn.1671-8348.2023.08.017网络首发https://kns.cnki.net/kcms/detail//50.1097.R.20230208.1630.002.html(2023-02-09)基于生物信息学分析KDM1A在肝细胞癌组织中的表达及意义*刘振华1,王宁2,李克跃1,汤可立1,徐贵1,丁杰3,张毅1△(1.贵州省人民医院肝胆外科三部/器官移植科,贵阳550002;2.贵州省骨科医院药剂科,贵阳550002;3.贵州省人民医院胃肠外科,贵阳550002)[摘要]目的分析赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1(KDM1A)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及意义。方法通过KM-plotter网站分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库、高通量基因表达(GEO)数据库收集的HCC组织及肝血管瘤旁正常肝组织中的RNA测序数据,比较KDM1A基因在HCC基因及正常肝组织中的表达及其临床意义;收集贵州省人民医院HCC免疫组织化学石蜡切片60例(分KDM1A高表达40例,低表达20例),正常肝组织20例,检测KDM1A的表达水平,并分析其表达水平与HCC患者临床病理特征间的关系,通过Kaplan-Meier分析KDM1A表达水平与HCC患者的生存关系。结果GEO、TCGA数据库HCC数据集分析结果显示KDM1A基因在HCC中的表达水平较正常肝组织高(P<0.01);免疫组织化学结果显示KDM1A在HCC组织中的表达水平也高于正常肝组织(P<0.01);KDM1A表达与HCC患者肿瘤最大径、微血管侵犯、TNM分期有关。生物信息学分析结果显示KDM1A基因与HCC患者的生存期相关,KDM1A基因高表达者总生存期(OS)、无复发生存期(RFS)、无进展生存期(PFS)、疾病特异性生存期(DSS)较KDM1A基因低表达者短(P<0.01);HCC患者中KDM1A高表达者较KDM1A低表达者OS更短(P<0.01)。结论KDM1A高表达为HCC患者预后不良的影响因素之一。[关键词]赖氨酸特异性去甲基化酶1;原发性肝癌;生物信息学;癌症基因组图谱[中图法分类号]R73-37[文献标识码]A[文章编号]1671-8348(2023)08-1202-06ExpressionandsignificanceofKDM1AinhepatocellularcarcinomatissuesbasedonbioinformaticsLIUZhenhua1,WANGNing2,LIKeyue1,TANGKeli1,XUGui1,DINGJie3,ZHANGYi1△(1.SectionofOrganTransplantation/ThirdDepartmentofHepatobiliarySurgery,GuizhouProvincialPeople’sHospital,Guiyang,Guizhou550002,China;2.DepartmentofPharmacy,GuizhouprovincialOrthopedicHospital,Guiyang,Guizhou550002,China;3.DepartmentofGastrointestinalSurgery,GuizhouProvincialPeople’sHospital,Guiyang,Guizhou550002,China)[Abstract]ObjectiveToanalyzetheexpressionandsignifican...
