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油菜茎基溃疡病菌检疫鉴定方法
GBT
31793-2015
油菜
溃疡
病菌
检疫
鉴定
方法
31793
2015
GB/T31793-2015AGGCGAGTCCCAAGTGGAACA-3)。PCR反应总体积为30L,包含10mmol/L Tris-HCI,50mmol/LKCI(pH8.3),1.5mmol/L MgCl2,dATP、dGTP、dCTP、dTTP浓度均为100mol/L,引物浓度各为100nmol/L,模板DNA为2L,1.5 U Taq DNA聚合酶。反应循环程序为943min:9430s,67(引物Lm2/6为60)30s,7230s,35个循环(引物Lm2/Lm6第一轮打扩增25个循环):最后725mi。第一轮扩增产物1L用作第二轮扩增的模板。取10L扩增产物与3L的6上样缓冲液混匀,在1.5%琼脂糖凝胶1TAE缓冲液中,4V/cm6V/cm电泳30min,溴化乙锭(EB)染色后在成像系统中成像分析。实时荧光PCR:引物Lm3(5-GCCCACCAATTGGATCCCCTA-3)/R2(5-GGCGCAAAATGTGCTGCGCT-3),探针Probe-M(5-FAM-CACTTGGGACTCGC-MGB3)。PCR反应体系为25L,包括12.5L2 X Premix Ex Taq、上下游引物(5mol/L)和探针(5mol/L)各1L、2L模板DNA,0.5L50 XROX Reference Dye,加无菌水补至25L。反应程序为:9510s;9515s,601min,40个循环。5鉴定特征5.1病菌形态初生菌丝无色,有分隔:菌丝呈白色放射状,初期可见结节状菌丝结,后期菌丝结形成黑色至褐色分生孢子器:分生孢子器球形至扁球形,褐色至深黑褐色,散生、埋生或半埋生于菌丝中,直径100m400m,顶部具孔口,周围有浅粉色、红色或紫色的黏性分生孢子团溢出,内含大量的分生孢子:分生孢子无色透明,椭圆形至纺锤形,内含2个油球,孢子大小(3.3m6.1m)(1.4m2.4um)。假囊壳在感病的木质化部位上产生,黑色,球形,埋生或爆裂,具孔口,直径360m500m:子囊棍棒形到圆柱形,双层壁,大小(70m120m)(10m17m),内含8个双列的子囊孢子,子囊孢子长椭圆形,黄褐色,具5个隔膜,大小(30m70m)(4m9m)。人工培养条件下未见有性型的形成。病菌形态图参见附录C中图C.1,与其近似种的形态比较参见附录D中表D.1。5.2PCR检测如常规PCR引物Lm3/九m4扩增产物为279bp,或引物LmacF/LmacR打扩增产物为331bp,视为油菜茎基溃场病菌阳性,如套式PCR引物Im2/1m6和Lm3/1m4扩增产物为279bp,视为油菜茎基溃疡病菌阳性。实时荧光PCR检测,在阳性对照、阴性对照和空白对照结果均正常的情况下:一C值小于或等于36,判定油菜茎基溃疡病菌阳性:一C1值大于或等于40,判定油菜茎基溃场病菌阴性,一C1值在3640之间,应重做实时荧光PCR,再次扩增后如C:值小于或等于36,或者C值大于或等于40,判定同上。6结果判定分离菌形态特征与5.1描述一致,且常规PCR、套式PCR或实时荧光PCR检测为阳性,可判定为油菜茎基溃扬病菌(Leptosphaeria maculans)。