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环境微生物宏基因组检测
高通量测序法
GBT
40226-2021
环境
微生物
宏基
检测
通量
测序法
40226
2021
GB/T40226-20213.5Q20测序数据中,减基识别质量值为20的减基识别准确率为99%,或错误率为1%。3.6Q30测序数据中,碱基识别质量值为30的碱基识别准确率为99,9%,或错误率为0.1%,4缩略语下列缩略语适用于本文件。DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid)D:识别码(identifier)PCR:聚合酶链式反应(polymerase chain reaction)RNA:核糖核酸(ribonucleic acid)5原理运用高通量测序技术对环境样品中微生物基因组D、A进行测序,再将测序结果与现有数据库中序列进行比对,从而检测样品中所含微生物种类和相对丰度。6试验条件6.1实验室设施和设备要求应符合GB19489的规定。6.2实验室用水应符合GB/T6682的规定。6.3实验室应做到防止污染,应根据不同工作内容划分独立区域,并有明显标志,如试剂储备和准备区、样品制备区、扩增区等,各区域间应避免交叉污染。7试剂7.1DNA提取试剂,7.2PCR产物纯化试剂。7.3文库制备试剂。7.4高通量测序试剂。8仪器设备8.1高通量测序仪。8.2PCR仪。8.3冷冻高心机:最大离心力12000g以上。8.4微量移液器。8.5紫外分光光度计。8.6荧光定量仪。2