论著·基础研究▲基金项目:国家自然科学基金(31970167);广西自然科学基金(2022GXNSFBA035660)第一作者简介:韦雪芹,在读硕士研究生,研究方向:传染病流行病学。通信作者简介:叶力,博士,教授,研究方向:传染病流行病学、病毒免疫学和分子病毒学。基于核糖核酸测序探讨马尔尼菲篮状菌感染致小鼠脑皮层损伤的机制▲韦雪芹1袁宗祥1,2张君涵1李炫蓉1韦吴迪1,2,3蒋俊俊1,2,3王凤仪1莫初叶1康旖雯1梁浩1,2,3叶力1,2,3[1广西医科大学公共卫生学院广西艾滋病防治研究重点实验室,广西南宁市530021;2中国(广西)-东盟新发传染病联合实验室,广西南宁市530021;3广西医科大学再生医学与医用生物资源开发应用省部共建协同创新中心,广西南宁市530021]【摘要】目的应用核糖核酸测序(RNA-seq)技术探讨马尔尼菲篮状菌(TM)致小鼠脑皮层损伤的可能机制。方法(1)将10只C57/BL6小鼠随机分为TM感染组和健康对照组(5只/组)后,分别经尾静脉注射TM分生孢子悬液、生理盐水。将BV2细胞和N2a细胞均随机分为TM感染组和空白对照组,TM感染组加入TM分生孢子悬液,空白对照组加入等量培养液。(2)建模成功后,取小鼠脑皮层组织进行RNA-seq后分析差异表达基因(DEGs);采用R4.1.2软件对DEGs进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体论(GO)功能富集分析等。取两组小鼠脑皮层组织及两组BV2细胞、N2a细胞,采用实时荧光定量PCR对富集通路相关DEGs、促炎因子进行体内体外验证。结果(1)共获得871个DEGs,其中上调基因373个、下调基因498个。KEGG通路富集分析结果显示,显著性最大的通路为氧化磷酸化通路(Q=9.60×10-3),基因数目比例最大的通路为神经退行性病变-多种疾病通路;GO功能富集分析结果显示,DEGs主要涉及细胞因子产生的正向调节、突触组织等生物学过程和组织。(2)体内体外验证结果表明,与对应对照组相比,TM感染组小鼠脑皮层组织和N2a细胞中Atp4a、Abcg3的mRNA表达水平均上调,Med8mRNA表达水平下调,N2a细胞中Ifi47、AA388235的mRNA表达水平上调(均P<0.05),TM感染组小鼠脑皮层组织及BV2细胞中白细胞介素6、白细胞介素1β和肿瘤坏死因子α的mRNA表达水平均上调(均P<0.05),均与RNA-seq结果一致。结论TM感染可能通过直接改变神经元细胞糖代谢,或间接激活小胶质细胞炎症反应,从而导致脑皮层损伤。【关键词】马尔尼菲篮状菌;脑皮层损伤;核糖核酸测序;氧化磷酸化;炎症反应;小鼠;细胞实验【中图分类号】R331;R519【文献标识码】A...