2023年2月第29卷第2期February.2023Vol.29No.2■■■■■■■■■■■■■■■■分析基于生物信息学分析Scoparone对肝癌的作用机制*杨玉雯1,姚元谦1,吕建林2,刘英1(1.广西中医药大学,广西南宁530001;2.广西中医药大学第一附属医院,广西南宁530023)[摘要]目的:研究茵陈活性成分6,7-二甲氧基香豆素(Scoparone)治疗肝癌的分子机制。方法:使用GEO数据库下载肝癌的芯片数据,从TCMSP数据库检索Scoparone的作用靶点,使用R软件获取肝癌差异基因;通过Jvenn和Cytoscape3.9.1软件筛选两者交集靶点,构建蛋白互作网络,进一步使用R软件对核心交集靶点进行GO、KEGG分析;使用AutoDockTools1.5.7及AutoDockVina软件进行分子对接,对活性成分与核心靶点的结合能力进行验证;使用TCGA数据库进行核心基因的生存预后分析。结果:得到肝癌显著性差异基因1788个、Scoparaone作用靶点100个,筛选出药物-疾病交集靶点97个。PPI拓扑分析得出的核心靶点有JAK1、JAK2、EGFR、ICAM1、KDR等。GO功能富集分析主要涉及氧化应激反应、蛋白质酪氨酸磷酸化及修饰、PI3K级联的正调节等,KEGG通路分析在主要富集在EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药机制、PI3K/Akt信号通路、上皮细胞信号传导通路、Rap1信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路、VEGF信号通路等途径。分子对接验证显示,Scoparone与核心靶点间结合能<-5.0kcal/mol。结论:Scoparone能通过调控JAK1、JAK2、EGFR、ICAM1、KDR等核心靶点,调控PI3K/Akt信号通路、上皮细胞信号传导通路、Rap1信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路、VEGF信号通路等途径,从而抑制肝癌细胞的增殖、侵袭,作用机制涉及氧化应激反应过程、蛋白质酪氨酸磷酸化及修饰、ATP结合等生物功能。[关键词]肝癌;6,7-二甲氧基香豆素;茵陈;GEO芯片挖掘;TCGA数据库;分子对接[中图分类号]R285.5[文献标识码]A[文章编号]1672-951X(2023)02-0127-06DOI:10.13862/j.cn43-1446/r.2023.02.026AnalysisontheMechanismofActionofScoparoneinLiverCancerBasedonBioinformaticsYANGYuwen1,YAOYuanqian1,LYUJianlin2,LIUYing1(1.GuangxiUniversityofTraditionalChineseMedicine,NanningGuangxi530001,China;2.TheFirstAffiliatedHospitalofGuangxiUniversityofTraditionalChineseMedicine,NanningGuangxi530023,China)[Abstract]Objective:Tostudythemolecularmechanismof6,7-dimethoxycoumarin(Scoparaone),theactiveingredientofInoceramus,inthetreatmen...