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大豆E3泛素连接酶基因Gm...物信息学分析和敲除载体构建_王昕.pdfVIP免费

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大豆科学SoybeanSciencehttp://ddkx.haasep.cn2023,42(2):165-174DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2023.02.0165大豆E3泛素连接酶基因GmHOS1a和GmHOS1b生物信息学分析和敲除载体构建王昕1,2,李聪1,3,许志永1,4,刘斌1,赵涛1,刘军1,李宏宇1(1.中国农业科学院作物科学研究所,北京100081;2.山东省德州市农产品质量检测中心,山东德州253000;3.广东省科学院南繁种业研究所,广东广州510316;4.黑龙江省金色北农种业科技有限公司,黑龙江哈尔滨150028)摘要:HIGHEXPRESSIONOFOSMOTICALLLYRESPONSIVEGENES1(HOS1)是植物中多种信号途径的整合因子,在植物发育、胁迫反应、光形态建成和开花调控中发挥至关重要的作用,是很有潜力的作物工程育种目标基因,但其在大豆中的功能尚未被揭示。为了揭示其在大豆中的功能,本研究利用反向遗传学,成功克隆了两个大豆HOS1基因,GmHOS1a和GmHOS1b,并通过生物信息学技术,对其蛋白结构、表达模式和功能进行了分析。进化树和结构域分析表明,GmHOS1a和GmHOS1b具有N端的环指结构域和与ELYS高度相似的保守基序,与拟南芥和水稻HOS1蛋白高度同源。亚细胞定位结果显示,GmHOS1a和GmHOS1b定位在细胞核中。QuantitativeReal-timePCR(qRT-PCR)结果表明,GmHOS1a和GmHOS1b的基因表达模式相似,均在三出复叶中高度表达。48h光周期RNA-sequencing(RNA-seq)和qRT-PCR分析表明,GmHOS1a和GmHOS1b基因的表达具有生物钟昼夜节律性,其中GmHOS1a的表达量显著高于GmHOS1b,GmHOS1a见光后表达量升高,黑暗前表达量达到峰值。为进一步探索GmHOS1a和GmHOS1b蛋白的功能,利用CRISPR/Cas9系统构建了9个GmHOS1a和GmHOS1b基因敲除载体,通过发根检测实验,筛选出6个高效工作载体,可供后续遗传转化实验使用。本研究为阐明该基因的功能和作用机理奠定了理论基础,并提供了可供遗传转化的载体材料。关键词:大豆;GmHOS1s;CRISPR/Cas9;E3泛素连接酶;亚细胞定位;生物钟收稿日期:2022-11-16基金项目:国家自然科学基金(32072091);湛江市领航计划项目(211207157080997)。第一作者:王昕(1994—),女,硕士研究生,主要从事生物化学与分子生物学研究。E-mail:WX940709@163.com。通讯作者:李宏宇(1970—),女,博士,研究员,主要从事植物分子生物学与基因工程研究。E-mail:lihongyu@caas.cn。BioinformaticsAnalysisandKnockoutVectorConstructionofSoybeanE3UbiquitinLigaseGeneGmHOS1aandGmHOS1bWANGXin1,2,LICon...

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