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欧李ChUFGT基因的克隆...生物信息学分析及亚细胞定位_王迪.pdfVIP免费

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分子植物育种,2023年,第21卷,第3期,第782-788页MolecularPlantBreeding,2023,Vol.21,No.3,782-788研究报告ResearchReport欧李ChUFGT基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位王迪*成冠超*祝利伟刘宇涵笈小龙宋兴舜**东北林业大学生命科学学院,哈尔滨,150040*同等贡献作者**通信作者,sfandi@163.com摘要为从分子水平上揭示欧李中3-O-类黄酮葡萄糖基转移酶(UFGT)基因的空间表达情况,以欧李叶片为试材,根据欧李的转录组序列设计特异性引物,通过PCR获得ChUFGT基因序列,并进行生物信息学分析及亚细胞定位分析。结果表明,ChUFGT基因DNA开放阅读框为1425bp(不含终止子),相对分子质量为51.63kD,编码475个氨基酸,其对应的蛋白质是带正电荷的稳定疏水性蛋白。与近缘物种的蛋白质序列比对分析显示,欧李、李和樱桃李的UFGT氨基酸序列相似度达到97.22%和96.62%,整个系统发育树存在两个大分支,其中ChUFGT与同科植物的亲缘关系最近,其次是与白梨、西洋梨、荔枝等其他科植物相对较近,与葡萄、刺葡萄、石榴等植物的亲缘关系最远。ChUFGT的亚细胞定位结果分析显示,在洋葱内表皮细胞的细胞核和细胞质中都表达该基因。本研究结果为进一步阐明ChUFGT调控欧李细胞花色素苷的合成机制提供了理论基础。关键词欧李(Cerasushumilis);UFGT基因;基因克隆;生物信息学分析;亚细胞定位Cloning,BioinformaticsAnalysisandSubcellularLocalizationofChUFGTGenefromCerasushumilisWangDi*ChengGuanchao*ZhuLiweiLiuYuhanJiXiaolongSongXingshun**CollegeofLifeScience,NortheastForestryUniversity,Harbin,150040*Theseauthorscontributedequallytothiswork**Correspondingauthor,sfandi@163.comDOI:10.13271/j.mpb.021.000782AbstractInordertorevealthespatialexpressionofthe3-o-flavonoidglucosyltransferase(UFGT)geneinCera-sushumilisatthemolecularlevel,specificprimersweredesignedaccordingtothetranscriptomesequenceofCerasushumilis,andthegenesequencewasobtainedbyPCR,andthebioinformaticsandsubcellularlocalizationexpressionanalysiswerecarriedout.TheresultsshowedthattheopenreadingframeofChUFGTgenewas1425bp(Withoutterminator),itsrelativemolecularweightwas51.63kD,encoding475aminoacids.Itscorrespondingproteinwasastablehydrophobicproteinwithpositivecharge.Comparisonwiththeproteinsequencesofrelatedspeciesshowedthatthesimi...

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