西北农业学报2023,32(2):179-186ActaAgriculturaeBoreali-occidentalisSinicadoi:10.7606/j.issn.1004-1389.2023.02.002https://doi.org/10.7606/j.issn.1004-1389.2023.02.002牦牛SMAD1基因第1外显子SNPs检测及与生长性状的关联分析收稿日期:2021-07-20修回日期:2021-09-25基金项目:国家自然科学基金(32060750);青海省科技项目(2019-SF-A3-2,2019-XYCX-3)。第一作者:周建强,男,硕士研究生,从事草食动物生产与改良研究。E-mail:1048269032@qq.com通信作者:刘秀,男,副研究员,主要从事草食动物生物技术及遗传育种研究。E-mail:liuxiu@gsau.edu.cn孙永刚,男,副研究员,主要从事动物遗传育种与繁殖研究。E-mail:sunyg2009@qq.com周建强1,司思2,祁增源1,韩银仓2,刘秀1,孙永刚2(1.甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃省草食动物生物技术重点实验室,兰州730070;2.青海省畜牧兽医科学院,西宁810016)摘要研究牦牛SMAD1基因第1外显子SNPs与生长性状的关系,寻找与牦牛生长性状相关的分子标记。采用DNA测序和单倍型分型技术,对青海牦牛SMAD1基因进行SNPs检测及其基因分型、连锁不平衡和单倍型分析,并对多态位点的基因型及组合单倍型与牦牛生长性状的关联性进行分析。结果发现,SMAD1在第1外显子上存在5个突变位点,其中,g.35084C>T、g.35111C>T和g.35333G>A均存在2种基因型,g.35171G>A和g.35312C>T均存在3种基因型。连锁不平衡分析发现5个位点间不存在强的连锁不平衡效应,单倍型分析发现存在6种不同的单倍型,其中单倍型Hap3的发生频率最高。关联性分析表明,g.35084C>T位点与胸围显著相关,g.35111C>T位点与体斜长、胸围显著相关,g.35171G>A和g.35312C>T位点与体质量、体高、体斜长和胸围显著相关,g.35333G>A位点与胸围、体高显著相关。通过基因型组合发现,4种组合单倍型均与牦牛生长性状有着显著或极显著相关,且H3H6可能是影响牦牛生...