北方园艺2023(3):1-7NorthernHorticulture·研究论文·第一作者简介:王宏霞(1986-),女,博士,副教授,现主要从事蔬菜分子植物育种等研究工作。E-mail:zj511102365@163.com.基金项目:青海省自然科学基金资助项目(2019-ZJ-984Q)。收稿日期:2022-06-07doi:10.11937/bfyy.20222346蒙古韭叶绿体微卫星特征分析王宏霞1,2,3,李文麒1(1.青海民族大学生态环境与资源学院,青海西宁810000;2.青海省特色经济植物高值化利用重点实验室,青海西宁810000;3.生物技术与分析测试实验室,青海西宁810000)摘要:以蒙古韭为试材,采用IlluminaNovaSep高通量测序技术对叶绿体基因组进行测序,MISAv1.0软件对叶绿体基因组微卫星进行搜索,研究了蒙古韭叶绿体微卫星特征,以期为蒙古韭的鉴定、居群遗传学研究和系统发育研究提供参考依据。结果表明:在蒙古韭153376bp的叶绿体全基因组序列上共识别出260个SSR位点,平均每590bp出现一个,主要分布于大拷贝区。cpSSR重复序列共有5种类型,其中单碱基重复序列最多,为181个,约占重复序列总量的66.79%,其次是三碱基重复序列,共65个,约占重复序列总量的23.99%,五碱基最少,仅占0.37%。cpSSR长度区间为8~29bp,从整体来看,主要集中在8~10bp,在该范围内共有197个,占SSR总数的75.77%;长度≥20bp的有9个,结果表明蒙古韭叶绿体基因组上的微卫星位点大多数具有多态性的潜能。关键词:蒙古韭;叶绿体;微卫星中图分类号:S633.3文献标识码:A文章编号:1001-0009(2023)03-0001-07蒙古韭(Alliummongolicum)属百合科葱属多年生鳞茎丛生草本植物[1],别名沙葱。蒙古韭在中国的分布区约在北纬36°28′~46°14′,东经88°39′~116°05′,包括陕西、甘肃、宁夏、内蒙古、新疆、青海6省(区)[2],主要分布在荒漠草原及沙漠地区的砂地、低山丘陵地、沙漠边缘、干旱的山坡和河床上[3]。蒙古韭地上部入蒙药能开胃、消食、杀虫等,所以蒙古韭作为一种山野菜具有极高的营养价值和药用价值[4],同时也是荒漠区马、牛、羊等抓膘促肥的优质牧草,此外蒙古韭极强的适应性...