收稿日期:2022-03-16基金项目:国家自然科学基金(31960370)和江西省自然科学基金(20202ACB205002)资助项目．通信作者:张帆涛(1984—)，男，江西临川人，副教授，博士，主要从事植物生物技术与分子生物学研究．E-mail:zhang84004@163．com杨晚铃，白芷懿，邹明珠，等:鹿茸草全长转录组测序与次生代谢产物生物合成相关基因的挖掘［J］．江西师范大学学报(自然科学版)，2023，47(1):99-110．YANGWanling，BAIZhiyi，ZOUMingzhu，etal．Thefull-lengthtranscriptomesequencingandidentificationofrelatedgenesinvolvedinsecondarymetabolismbiosynthesisinMonochasmasavatieri［J］．JournalofJiangxiNormalUniversity(NaturalScience)，2023，47(1):99-110．文章编号:1000-5862(2023)01-0099-12鹿茸草全长转录组测序与次生代谢产物生物合成相关基因的挖掘杨晚铃，白芷懿，邹明珠，王欣茹，谢建坤，张帆涛*(江西师范大学生命科学学院，江西南昌330022)摘要:为获得鹿茸草的全长转录组信息，挖掘鹿茸草次生代谢化合物生物合成途径相关酶的基因，该文基于单分子测序技术，利用Pacbio高通量测序平台，对鹿茸草进行全长转录组测序，共获得48005条去冗余的高质量转录本，与NＲ、Swiss-Prot、GO、KEGG等8个数据库进行BLAST比对，共有45362个转录本被成功注释，注释率为94．50%．其中有389条转录本被注释到KEGG的10条标准次生代谢生物合成通路中．对转录组数据进一步分析发现:参与鹿茸草苯丙素类生物合成的转录本有194条，参与生物碱类生物合成的转录本有115条，参与类黄酮化合物生物合成的转录本有23条，参与其他次生代谢产物的转录本有57条，参与次生代谢后氧化与糖基化修饰的转录本有204条．鹿茸草全长转录组的获得极大地丰富了鹿茸草的遗传信息，初步揭示了参与鹿茸草次生代谢产物合成相关的基因通路，为深入研究鹿茸草次生代谢产物合成途径关键酶的功能及其调控机制奠定了基础．关键词:鹿茸草;全长转录组;次生代谢;生物合成;遗传资源中图分类号:S567文献标志码:ADOI:10．16357/j．cnki．issn1000-5862．2023．01．130引言鹿茸草(MonochasmasavatieriFranch．exMax-im)为玄参科鹿茸草属多年生根半寄生植物，别称有沙氏鹿茸草、白花鹿茸草、千重塔等，常生于阳光充足的多沙山坡及灌丛中，主要分布在中国的东南地区，如江苏省、安徽省、浙江省、福建省、江西省、湖南省等，在日本九州也有分布［1-2］．鹿茸草的根、茎、叶皆可入药，其性质平和，味略微苦涩，主...
