基于转录组技术的枫叶鲑亲本鉴定和杂交优势分析刘玉猛1，蒋洁兰2，3，毛明光2，3*，朱诗裕3，王伟1(1．大连海洋大学海洋科技与环境学院，辽宁大连116023;2．海南热带海洋学院崖州湾创新研究院，海南三亚572024;3．海南热带海洋学院/海南热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室，海南三亚572022)摘要为探究枫叶鲑的亲本来源及杂种抗病优势，采用Illumina高通量测序技术对枫叶鲑的胸腺和头肾组织转录组进行测序分析。结果获得胸腺组织原始数据8224345800bp，拼接获得169204条单基因序列(Unigene);头肾组织原始数据7409864400bp，拼接获得132292条Unigene。利用生物信息学方法对Unigene进行NＲ库相似搜索，还进行了GO、KOG和KEGG分类注释。通过比对线粒体DNA(mtDNA)基因序列发现，枫叶鲑与虹鳟(Oncorhynchusmykiss)的线粒体基因同源性达99%以上，可判定枫叶鲑母本是虹鳟;E3、TNF－α、IGM等基因的同源性在大鳞大麻哈鱼(Oncorhynchustshawytscha)中比虹鳟高，推测枫叶鲑父本可能是大鳞大麻哈鱼。对免疫相关基因分析发现，IgM、TNF－α和T、B淋巴细胞相关基因序列与父、母本同源性均较高，因此初步判定枫叶鲑抗病优势是父、母本双方杂交的结果。通过转录组分析杂交种的抗病优势存在盲区，但该技术可以快速判断父、母本的来源，获得大量遗传信息，优势明显。关键词枫叶鲑;转录组;亲本鉴定;抗病优势分析中图分类号S917．4文献标识码A文章编号0517－6611(2023)01－0098－06doi:10．3969/j．issn．0517－6611．2023．01．021开放科学(资源服务)标识码(OSID):ParentalIdentificationandHybridVigorAnalysisofMapleSalmonBasedonTranscriptomeTechnologyLIUYu-meng1，JIANGJie-lan2，3，MAOMing-guang2，3etal(1．CollegeofOceanTechnologyandEnvironment，DalianOceanUniversi-ty，Dalian，Liaoning116023;2．YazhouwanInnovationＲesearchInstitute，HainanTropicalOceanUniversity，Sanya，Hainan572024;3．KeyLaboratoryofUtilizationandConservationforTropicalMarineBioresources，MinistryofEducation/HainanTropicalOceanUniversity，Sanya，Hainan572022)AbstractInordertoexploretheparentoriginandhybriddiseaseresistanceofmaplesalmon，Illuminahigh-throughputsequencingtechnologywasusedtosequenceandanalyzethetranscriptomeofthymusandheadkidneytissuesofmaplesalmon．Theoriginaldataofthymustissuewas8224345800bp，and169204Unigen...
