基于TCGA数据的膀胱癌坏死性凋亡相关lncRNA预后模型的建立与验证彭克楠1,宁静源2,谭鹤1,范小晴2,帖彦清1,宋学东3(1.河北省人民医院检验科,河北石家庄050051;2.河北医科大学免疫教研室,河北石家庄050017;3.邯郸中心医院检验科,河北邯郸056001)DOI:10.11748/bjmy.issn.1006-1703.2022.11.025收稿日期:2022-08-18;修回日期:2022-10-11基金项目:河北省医学科学研究重点课题计划项目(编号:20180126)通讯作者:帖彦清。摘要:目的探索影响膀胱癌(BLCA)患者的坏死性凋亡相关长链非编码RNA(longnoncodingRNA,lncRNA),构建膀胱癌患者的预后预测模型并进行验证。方法从美国癌症肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载膀胱癌的临床病例资料和转录组数据,通过单因素及多因素COX回归分析筛选出有差异的坏死性凋亡相关lncRNAs,建立了膀胱癌患者的坏死性凋亡相关基因预后预测模型。根据风险分数将所有患者分为高危组和低危组,采用Kaplan-Meier方法分析膀胱癌患者的总生存时间对预后预测模型进行验证,最后开发动态列线图便于临床使用。结果本研究筛选出8个预后相关的坏死性凋亡相关lncRNAs(AL354919.2、LINC00649、TTC28-AS1、AL031775.1、NR2F1-AS1、AL049840.3、LINC01871、Z84484.1),构建膀胱癌预后预测模型,结果显示高危组患者的总体生存期(OS)均显著低于低危组(P<0.05)。高危组和低危组绘制的受试者工作特征曲线(receiveroperatingcharacteristiccurve,ROC)发现风险评分的曲线下面积(theareaunderthecurve,AUC)值为0.850,1、3、5年的AUC分别为0.72、0.78、0.80。动态列线图具有良好的准确性。结论基于坏死性凋亡相关lncRNAs的膀胱癌预后模型可以有效预测患者预后,有助于了解与坏死性凋亡相关的lncRNAs在膀胱癌中的作用,并为膀胱癌临床治疗提供新的手段。关键词:膀胱癌;坏死性凋亡;lncRNA;预后中图分类号:R737.14文献标识码:AAPredictiveSignatureofBladderCancerBasedNecroptosis-RelatedLncRNAsandItsValidationPENGKenan1,NINGJingyuan2,TANHe1,FANXiaoqing2,TIEYanqing1,SONGXuedong3(1.LaboratoryDepartmentofHebeiGeneralHospital,Shijiazhuang050051,China;2.DepartmentofImmunology,HebeiMedicalUniversity,Shijiazhuang050017,China;3.DepartmentofClinicalLaboratory,CentralHospitalofHandan,Handan056001,China)Abstract:ObjectiveThepurposeofthisstudywastoapplynecroptosis-relatedlongnon-codingRNAs(LncRNAs)toconstructapredictivesignaturefortheprog...
