2023年第45卷第2期ChinaPoultryVol.45，No.2.2023®遗传育种遗传育种基于基于GBSGBS简化基因组技术的我国家养雉鸡简化基因组技术的我国家养雉鸡系统发育分析系统发育分析陈芳1，吴琼1*，涂健峰2，覃健峰1，郑德滨1，向仕玺1，高荣1（1.龙岩学院生命科学学院，福建龙岩364012；2.中国农业科学院特产研究所，吉林长春130112）摘要：为分析我国家养雉鸡遗传背景和起源进化关系，采用高通量简化基因组测序方法对我国家养6个雉鸡群体（美国七彩雉鸡、蒙古雉鸡、黑化雉鸡、白羽雉鸡、绿雉鸡、申鸿七彩雉）的分类起源关系进行分析。结果表明：获得雉鸡Cleanbase数据分别为330.44×106Gb，340.64×106Gb，348.50×106Gb，291.67×106Gb，286.44×106Gb和324.98×106Gb，Q20≥92%、Q30≥85%，GC分布正常，共挖掘到50078个有效SNP位点。通过系统进化树、主成分和群体遗传结构分析，6个雉鸡种群可分为两大类，申鸿七彩雉、黑化雉鸡、白羽雉鸡、绿雉鸡和美国七彩雉鸡为一类，蒙古雉鸡单独为一类。研究揭示家养雉鸡种群在长期的养殖过程中存在基因交流。关键词：雉鸡；GBS；SNP；遗传多样性；系统发育中图分类号：S839.2文献标识码：A文章编号：1004-6364（2023）02-15-05收稿日期：2022-03-05；修回日期：2022-05-07基金项目：科技部国家科技基础条件平台“特种动物种质资源库”（TZDWZYK2019-07）作者简介：陈芳（2000-），女，本科生，专业方向为动物科学，E-mail：chfchen0926@qq.com*通讯作者：吴琼（1978-），女，博士，副教授，主要从事特禽资源评价和遗传育种研究，E-mail：106565789@qq.comdoi：10.16372/j.issn.1004-6364.2023.02.003StudyonPhylogeneticRelationshipofCommonPheasantwithGenotypingbySequencing(GBS)CHENFang1,WUQiong1*,TUJianfeng2,QINJianfeng1,ZHENGDebin1,XIANGShixi1,GAORong1（1.CollegeofLifeScience,LongyanUniversity,Longyan,Fujian364012；2.InstituteofSpecialAnimalandPlantSciencesofCAAS,Changchun,Jilin130112）Abstract：Thisstudyaimedtoanalyzegeneticbackgroundandevolutionofbreedingcommonpheasant.Chinesering-neckedpheasant,Mongolianpheasant,blackpheasant,whitepheasant,greenpheasantandShenhongpheasantwereanalyzedwiththehighthroughputsimplifiedgenomicsequencingmethod.Theresultsshowedthat330.44×106Gb,340.64×106Gb,348.50×106Gb,291.67×106Gb,286.44×106Gb,324.98×106Gbofcleanbaseda...
