·生物信息学·doi:10.3969/j.issn.1671-8348.2023.04.019网络首发https://kns.cnki.net/kcms/detail/50.1097.R.20220927.1233.014.html(2022-09-28)SOX4基因表达特征的泛癌分析*李子木1,闫虹1,董囡囡1,康媛媛2(1.中国人民解放军北部战区总医院口腔内科,沈阳110013;2.中国医科大学口腔医学院急诊黏膜科,沈阳110001)[摘要]目的通过生物信息学方法探讨并验证SOX4基因在泛癌中的表达特征。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)对SOX4基因进行泛癌分析,从基因表达、生存分析、基因突变、免疫浸润及富集分析等多个方面挖掘SOX4在不同肿瘤致病中的作用。利用定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Westernblotting)验证SOX4在3种常见肿瘤细胞系中的表达情况。结果SOX4在大多数肿瘤中高表达,且与部分肿瘤患者的预后存在明显相关性。在口腔鳞状细胞癌细胞、乳腺癌细胞和人非小细胞肺癌细胞中,SOX4mRNA和蛋白的水平明显升高。在膀胱尿路上皮癌患者中,SOX4的突变发生率最高。在部分肿瘤中,SOX4的表达与免疫细胞浸润密切相关。SOX4可能通过“病毒致癌”和“肿瘤MicroRNA”通路参与肿瘤的发生。结论SOX4在多种肿瘤的致病中起重要作用,可能是治疗肿瘤的有效靶点。[关键词]SOX4;肿瘤;预后;免疫浸润;富集分析[中图法分类号]R73[文献标识码]A[文章编号]1671-8348(2023)04-0576-07Pan-canceranalysisofSOX4geneexpressionsignature*LIZimu1,YANHong1,DONGNannan1,KANGYuanyuan2(1.DepartmentofStomatology,GeneralHospitalofPLANorthernTheaterCommand,Liaoning,Shenyang110013,China;2.DepartmentofEmergencyMucosa,SchoolofStomatology,ChinaMedicalUniversity,Shenyang,Liaoning110001,China)[Abstr...