第49卷第2期2023年3月吉林大学学报（医学版）JournalofJilinUniversity（MedicineEdition）Vol.49No.2Mar.2023DOI：10.13481/j.1671⁃587X.20230218COMMD7在脑低级别胶质瘤发生发展中作用机制的生物信息学分析王小燕1,2,胡溢洪3,韩语诚3,邹先琼3（1.桂林医学院智能医学与生物技术学院实验教学中心，广西桂林541199；2.广西高校生物化学与分子生物学重点实验室，广西桂林541199；3.桂林医学院智能医学与生物技术学院生物医学工程教研室，广西桂林541199）［摘要］目的目的：通过生物信息学方法分析COMM域包含蛋白质7（COMMD7）的表达水平与脑低级别胶质瘤（LGG）患者预后之间的关系，以期寻找脑LGG新的潜在生物标志物，并建立预后预测模型，为患者预后预测及个性化治疗提供依据。方法方法：从UCSC基因组数据库下载523个脑LGG样本和1152正常样本的数据。采用Mann-WhitneyU检验分析COMMD7在脑LGG样本和正常样本中的表达差异，并采用人类蛋白图谱（HPA）数据库进行验证。使用R语言的DESeq软件包对COMMD7低表达组和COMMD7高表达组脑LGG样本进行差异表达基因（DEGs）鉴定，采用R语言的pROC软件包进行受试者工作特征（ROC）曲线分析，采用单因素和多因素Cox回归分析COMMD7表达与脑LGG患者临床病理特征的关系及对脑LGG患者1、3和5年生存率的影响，采用R语言的ggplot2软件包构建森林图，采用R语言的RMS软件包和Survival软件包构建列线图和Calibration预测模型，采用比例风险回归模型分析COMMD7用于区分脑LGG样本和正常样本的诊断价值。采用GEPIA数据库及Oncolnc数据库进一步验证COMMD7与脑LGG患者预后的关系。使用基因本体（GO）功能注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）对DEGs进行功能和通路富集分析，使用基因集富集分析（GSEA）获得DEGs显著富集的基因集，采用TISIDB数据库分析COMMD7表达与脑LGG患者免疫细胞浸润之间的相关性。结果结果：COMMD7在脑LGG样本中表达明显上调，HPA检测结果显示COMMD7在脑LGG样本中高表达。分析得到了764个DEGs（|log2FC|>1，P<0.05），包括654个上调和110个下调DEGs。基于多因素分析的预测模型显示COMMD7是一个独立的预后因素。ROC分析，COMMD7用于区分癌组织和癌旁组织具有较高的诊断价值［ROC曲线下面积（AUC）=0.835，95%CI：0.816~0.853］。Cox回归分析，COMMD7高表达组脑LGG患者生存率明显低于COMMD7低表达组，COMMD7高表达与LGG患者的预后不良呈明显正相关关系（P<0.001）。GEPIA数据库514个脑LGG样本分析和Oncolnc...
