·实验与基础研究/论著·CADM-1对人宫颈癌Hela细胞转录组学的影响及意义刘晔1,2,朱宇2,周建斌1,杜洪灵2,胡华3,蔡骁垚4,蒋漪桦21.南华大学衡阳医学院,附属第二医院,妇产科,湖南衡阳421001;2.上海市普陀区人民医院妇产科,上海200060;3.南华大学衡阳医学院附属第二医院病理科;4.上海市普陀区人民医院中心实验室基金项目:湖南省自然科学基金项目科卫联合基金项目(2021JJ70112)通信作者:周建斌,E-mail:546612589@qq.com摘要:目的探讨粘附分子CADM-1基因对人类宫颈癌细胞系Hela细胞转录组学的影响。方法构建rLV-hCADM-1-ZsGreen-Puro慢病毒和rLV-ZsGreen-Puro对照慢病毒,将感染rLV-hCADM-1-ZsGreen-Puro慢病毒的Hela细胞作为rLV-CADM-1组,将感染rLV-ZsGreen-Puro对照慢病毒的Hela细胞作为rLV组。筛选差异基因集并进行基因转录能力、基因本体(GO)功能、京都基因与基因组数据库(KEGG)信号通路、Reactome通路及疾病本体(DO)功能分析。结果rLV-CADM-1组CADM-1相对表达量(38.57±2.58)显著高于rLV组(0.90±1.08),差异有统计学意义(t=20.460,P<0.05)。基因差异分析共筛选出321个差异表达的基因,其中表达上调171个、表达下调150个。差异最显著的前10个表达上调基因包括OLFM1、TUSC3、ENSG00000285779、SPARC、CCL5、ENSG00000261512、CADM-1、OAS1、CLIC3及CSAG3。差异最显著的前10个表达下调基因包括COL16A1、SYTL4、ENSG00000278996、CGA、SLC47A1、TNC、ENSG00000276570、UGT3A1及MARCOL。功能分析结果显示,CADM-1改变了Hela细胞部分基因的转录能力、参与调控GO功能、KEGG信号通路、Reactome通路及DO功能。结论CADM-1可明显影响Hela细胞的转录组学。关键词:CADM-1;转录组学;宫颈癌中国图书分类号:R711.74文献标识码:A文章编号:1001-4411(2023)03-0516-07;doi:10.19829/j.zgfybj.issn.1001-4411.2023.03.034EffectandsignificanceofCADM-1onthetranscriptomeofhumancervicalcancerHelacellsLIUYe*,ZHUYu,ZHOUJian-bin,DUHong-ling,HUHua,CAIXiao-yao,JIANGYi-hua*TheSecondAffiliatedHospital,DepartmentofObstetricsandGynecology,HengyangMedicalSchool,UniversityofSouthChina,Hengyang,Hunan421001,China;DepartmentofObstetricsandGynecology,PutuoDistrictPeople'sHospitalofShanghai,Shanghai,200060,ChinaAbstract:ObjectiveToinvestigatetheeffectofCADM-1geneonthetranscr...