2015—2020年某院C...碳青霉烯酶基因检测结果分析_黄加铭.pdf

论 著D O I:1 0.3 9 6 9/j.i s s n.1 6 7 2-9 4 5 5.2 0 2 3.0 4.0 1 32 0 1 52 0 2 0年某院C R E分布、耐药性及碳青霉烯酶基因检测结果分析*黄加铭1,王 启2,徐玉金1,孙细欢1,黄东红11.福建医科大学附属第二医院微生物实验室,福建泉州 3 6 2 3 0 0;2.北京大学人民医院检验科,北京 1 0 0 0 4 4 摘 要:目的 了解碳青霉烯耐药肠杆菌(C R E)的临床分布、耐药性及碳青霉烯酶基因型,为C R E感染的治疗及医院感染防控提供依据。方法 收集2 0 1 5年1月1日至2 0 2 0年1 2月3 1日福建医科大学附属第二医院临床分离的C R E菌株,采用m i c r o f l e x L R F MA L D I-TO F型质谱微生物鉴定仪进行菌种鉴定;采用微量肉汤稀释法或琼脂稀释法检测多黏菌素B、替加环素、头孢他啶/阿维巴坦和磷霉素等1 6种抗菌药物的最低抑菌浓度(M I C)。采用聚合酶链反应检测常见碳青霉烯酶基因(b l a K P C、b l a N DM、b l a I MP、b l a V I M、b l a O X A-4 8)及黏菌素耐药基因m c r-1并测序确认;采用多位点序列分型(ML S T)法确定肺炎克雷伯菌的序列分型(S T)。结果 3 8株C R E中,肺炎克雷伯菌1 5株,大肠埃希菌1 3株,其他肠杆菌目细菌1 0株;主要分离自痰液、血液及尿液标本;来自普内科的分离率占比最高(2 3.6 9%);3 8株C R E对替加环素、多黏菌素B呈现较低耐药率(5.2 6%、1 3.1 6%),对阿米卡星、磷霉素、米诺环素和氨曲南的耐药率均7 1%。最常见的碳青霉烯酶基因型是b l a N DM(6 5.7 1%),其次是b l a K P C(2 2.8 6%)和b l a I MP(8.5 7%),在1 5株肺炎克雷伯菌中鉴定出9种不同的S T,其中S T 1 1型7株(4 6.6 7%)。结论 该院C R E仅对替加环素、多黏菌素B等少数抗菌药物呈现较好敏感性,产b l a N DM型碳青霉烯酶是肠杆菌目细菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药的主要原因;S T 1 1型肺炎克雷伯菌是碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的主要流行克隆菌株,未发现该地区的克隆菌株暴发流行。关键词:肠杆菌目细菌;碳青霉烯酶;耐药性中图法分类号:R 4 4 6.5文献标志码:A文章编号:1 6 7 2-9 4 5 5(2 0 2 3)0 4-0 4 9 0-0 5A n a l y s i s o f C R E d i s t r i b u t i o n,d r u g r e s i s t a n c e a n d c a r b a p e n e m a s e g e n e d e t e c t i o n r e s u l t s i n a h o s p i t a l f r o m 2 0 1 5 t o 2 0 2 0*HU ANG J i a m i n g1,WANG Q i2,XU Y u j i n1,S UN X i h u a n1,HU ANG D o n g h o n g11.M i c r o b i o l o g y L a b o r a t o r y,t h e S e c o n d A f f i l i a t e d H o s p i t a l o f F u j i a n M e d i c a l U n i v e r s i t y,Q u a n z h o u,F u j i a n 3 6 2 3 0 0,C h i n a;2.D e p a r t m e n t o f C l i n i c a l L a b o r a t o r y,P e k i n g U n i v e r s i t y P e o p l e s H o s p i t a l,B e i j i n g 1 0 0 0 4 4,C h i n aA b s t r a c t:O b j e c t i v e T o i n v e s t i g a t e t h e c l i n i c a l d i s t r i b u t i o n,d r u g s u s c e p t i b i l i t y a n d c a r b a p e n e m a s e g e n o-t y p e s o f c a r b a p e n e m-r e s i s t a n t E n t e r o b a c t e r a l e s(C R E),t o p r o v i d e t h e e v i d e n c e f o r C R E t h e r a p y a n d n o s o c o-m i a l i n f e c t i o n c o n t r o l.M e t h o d s C R E s t r a i n s w e r e c o l l e c t e d f r o m t h e S e c o n d A f f i l i a t e d H o s p i t a l o f F u j i a n M e d i c a l U n i v e r s i t y f r o m J a n u a r y 1,2 0 1 5 t o D e c e m b e r 3 1,2 0 2 0,t h e i s o l a t e s w e r e r e-i d e n t i f i e d b y m i c r o f l e x L R F MA L D I-TO F t y p e m a s s s p e c t r o m e t r y m i c r o b i o l o g i c a l i d e n t i f i c a t i o n i n s t r u m e n t.T h e m i n i m u m i n h i b i t o r y c o n c e n t r a t i o n s(M I C)o f t i g e c y c l i n e,c o l i s t i n,f o s f o m y c i n a n d o t h e r a n t i b a c t e r i a l d r u g s w e r e d e t e r m i n e d u s i n g m i c r o d i l u t i o n o r a g a r d i l u t i o n m e t h o d.P o l y m e r a s e c h a i n r e a c t i o n w a s u s e d t o d e t e c t t h e p r e s e n c e o f c a r b a p e n e-m a s e g e n e s(b l a K P C,b l a N DM,b l a I MP,b l a V I M,b l a O X A-4 8)a n d c o l i s t i n r e s i s t a n c e g e n e(m c r-1),m u l t i l o c u s s e q u e n c e t y p i n g(ML S T)w a s u s e d t o a n a l y z e s e q u e n c e t y p i n g(S T)o f K l e b s i e l l a p n e u m o n i a e s t r a i n s.R e s u l t s Am o n g t h e 3 8 s t r a i n s o f C R E,1 5 s t r a i n s w e r e K l e b s i e l l a p n e u m o n i a e,1 3 s t r a i n s w e r e E s c h e r i c h i a c o-l i,1 0 s t r a i n s w e r e o t h e r E n t e r o b a c t e r a l e s.T h e 3 8 C R E s t r a i n s w e r e m a i n l y i s o l a t e d f r o m s p u t u m,b l o o d a n d u-r i n e s a m p l e s.T h e d i s t r i b u t i o n r a t e o f D e p a r t m e n t o f G e n e r a l I n t e m a l M e d i c i n e w a s t h e h i g h e s t(2 3.6 9%).T h e 3 8 C R E s t r a i n s s h o w e d l o w r e s i s t a n c e r a t e s t o t i g e c y c l i n e (5.2 6%)a n d c o l i s t i n(1 3.1 6%).T h e r e s i s t a n c e r a t e s t o a m i k a c i n,f o s f o m y c i n,m i n o c y c l i n e a n d a z t r e o n a m w e r e 7 1%,m o s t c o mm o n d e t e c t e d c a r b a p e n e m a s e g e n e w a s b l a N DM(6 5.7 1%),f o l l o w e d b y b l a K P C(2 2.8 6%)a n d b l a I MP(8.5 7%).N i n e d i s t i n c t S T w e r e i d e n t i f i e d a m o n g 1 5 K l e b s i e l l a p n e u m o n i a e,t h e r e w a s 7 t r a n i s w e r e S T 1 1 t y e a m o n g t h e m.C o n c l u s i o n T h e C R E s t r a i n s w e r e o n l y s u s c e p t i b l e t o a f e w a n t i b a c t e r i a l d r u g s,s u c h a s t i g e c y c l i n e a n d c o l i s t i n.T h e p r o d u c t i o n o f b l a N DM c a r b a p e n e m a s e w a s t h e m a i n r e a s o n f o r t h e r e s i s t a n c e o f E n t e r o b a c t e r a l e s t o c a r b a p e n e m s.S T 1 1 t y p e K l e b s i e l l a p n e u m o n i a e w a s t h e m a i n e p i d e m i c c l o n e o f c a r b a p e n e m-r e s i s t a n t K l e b s i e l l a p n e