第46卷第1期2023年1月河北农业大学学报JOURNALOFHEBEIAGRICULTURALUNIVERSITYVol.46No.1Jan.2023半夏3种花叶病毒的mRT-PCR鉴定及遗传进化分析李锦超1，董俊美1，孟义江2，杨太新1，葛淑俊1（1.河北农业大学农学院/教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室，河北保定071000；2.河北农业大学生命科学学院/教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室，河北保定071000）摘要：半夏（Pinelliaternata）因长期无性繁殖导致病毒病高发。本研究以河北安国疑似病毒感染的半夏为材料，通过优化扩增反应体系及反应程序，建立了可以同时检测黄瓜花叶病毒（Cucumbermosaicvirus,CMV）、大豆花叶病毒（Soybeanmosaicvirus,SMV）和芋花叶病毒（Dasheenmosaicvirus,DsMV）的多重RT-PCR体系，RNA稀释106倍时亦能同时检测3种病毒。对侵染病毒外壳蛋白进行基因克隆和遗传进化分析，结果表明CMV的外壳蛋白编码区序列为657bp，与浙江侵染半夏的CMV（DQ399550.1）序列相似性高达96.16%，与感染其他寄主的病毒序列差异较大；SMV和DsMV外壳蛋白序列分别为843和828bp，与同种株系遗传变异度分别达到0.38和0.37以上，独立为1个进化支。生物信息学统计分析发现，病毒外壳蛋白序列高度保守，具有较为丰富的变异位点，碱基转换率大于颠换率，CMVAT偏倚度大于GC，SMV、DsMV与之相反。研究结果为半夏病毒检测和脱毒提供了技术和理论基础。关键词：半夏；花叶病毒；多重RT-PCR；遗传进化中图分类号：S432.4+1开放科学（资源服务）标识码（OSID）：文献标识码：AmRT-PCRidentificationandgeneticevolutionanalysisofmosaicvirusesinthreePinelliaternataLIJinchao1,DONGJunmei1,MENGYijiang2,YANGTaixin1,GEShujun1（1.CollegeofAgronomy,HebeiAgriculturalUniversity/KeyLaboratoryofCropGermplasmResourcesresearchandUtilizationinNorthChina,MinistryofEducation,Baoding071000,China;2.CollegeofLifeScience,HebeiAgriculturalUniversity/KeyLaboratoryofCropGermplasmResourcesresearchandUtilizationinNorthChina,MinistryofEducation,Baoding071000,China）Abstract:TheincidenceofviraldiseaseishighinPinelliaternataduetolong-termasexualreproduction.Inthisstudy,amultiplexRT-PCRsystemwasestablishedtodetectCucumbermosaicvirus(CMV),Soybeanmosaicvirus(SMV)andDasheenmosaicvirus(DsMV)simultaneouslyinpinelliathatwassuspectedofvirusinfectioninAnguo,Heb...
