2023年首个园艺类作物全基因变异数据库发布.docx
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2023
年首个
园艺
作物
基因
变异
数据库
发布
首个园艺类作物全基因变异数据库发布
近日，園艺研究在线发表了中国农业科学院柑橘研究所构建完成的柑橘全基因组变异数据库CitGVD，这是第一个园艺类作物全基因变异数据库。
该数据库中，变异数据包括单核苷酸多态性和插入缺失。CitGVD V1.0包含了来自内部测序工程和公共资源的346个种质的1 493 258 964个高质量基因组变异位点和84个表型数据。
CitGVD集成了基因组变异位点注释、相关基因注释以及有关种质的详细信息，并集成了多种内置工具来进行数据访问和深入分析。这些功能使CitGVD成为柑橘相关研究的综合Web门户和生物信息学平台，也为构建其他农作物的全基因组变异数据平台提供了范例。
