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2023
银杏叶
部内生
真菌
多样性
研究
Vol.28 No.4 511
://journals.im.ac /jwxtcn
银杏叶部内生真菌多样性的研究
杜少康 陈双林x 林岱 吴鸣谦 王梅霞
南京师范大学生命科学学院 南京 210046
摘 要:为了解我国特有植物银杏的叶部组织中内生真菌菌群的多样性和演替变化,分别于春、夏、秋季从江苏和山东两省的五个主要银杏栽培地采集健康叶片进行了内生真菌的研究。结果说明:所别离出的1971株内生真菌可归于32属,以交链孢属Alternaria〔18.01%〕、叶点霉属Phyllosticta〔14.66%〕和丝核菌属Rhizoctonia〔14.56%〕为优势菌群。在内生真菌的类群及组成上存在着部位、地区以及季节的差异性,也呈现一定的规律性。多样性指数的计算反映出所获得的银杏叶部内生真菌菌群具有不同的丰富度及均匀度,同时有一定的相似性。
关键词:别离率,别离频率,优势菌群,多样性指数,相似性系数
Diversity of endophytic fungi in leaves of Ginkgo biloba
DU Shao-Kang CHEN Shuang-Linx LIN Dai WU Ming-Qian WANG Mei-Xia
College of Life Science, Nanjing Normal University, Nanjing 210046, China
Abstract: Diversity of endophytic fungi in leaves of Ginkgo biloba was studied in order to understand diversity state and succession change of endophytic fungal communities in this endemic plant. Healthy leaf samples were collected from five main planting locations of G. biloba in Jiangsu and Shandong provinces separately in spring, summer and autumn. A total of 1971 strains of endophytic fungi was isolated. As a result of morphological identification 32 genera were obtained, of which Alternaria (amounting to 18.01% of the total), Phyllosticta (14.66%) and Rhizoctonia (14.56%) were dominant. The distribution and composition of endophytic fungi varied with plant organs colonized, localities and seasons, but they assumed regularity to a certain extent. Populations of endophytic fungi in different parts of the leaves indicated different abundance and uniformity but assumed similarity to a certain extent.
Key words: isolation rate, isolation frequency, dominant population, diversity index, similarity coefficient
从de Bary在1866年指出植物中存在有内生微生物,特别是从上个世纪80年代至今,大量的植物内生真菌资源被开掘出来,从而也证实了内生真菌在植物体内是普遍存在的〔郭良栋 2023〕。从不同植物中别离到的内生真菌数量不同,Fisher et al.〔1993〕从光叶大戟Eucalyptus nitens Maiden上别离到60多种内生真菌。但是仅凭种数多寡来评价某种植物的内生真菌多样性丰富与否虽然直观却不够科学、客观和准确。另一方面,已有的研究资料说明:由于协同进化的作用使得某些内生真菌具有宿主专一性,平均每种植物有4-5种专性内生真菌〔Petrini 1991〕,因此,选择特有植物根据别离率分析内生真菌的特定组成和演替变化、运用多样性指数来评价其内生真菌的丰富度将有助于植物内生真菌多样性研究的深入。
银杏Ginkgo biloba L.是单科单属单种的多年生落叶乔木,为我国特有树种。其内生真菌的研究主要是由国内一些研究者开展,且主要集中在生物活性菌株的研究上,如对与宿主银杏相似的黄酮类化合物产生菌的别离和鉴定〔王梅霞等 2023;韩晓丽等 2023〕,对产香的银杏内生镰刀菌G1024菌株的生物学特性和挥发性成分的研究〔蒋继宏等 2023;鞠秀云等 2023〕,对银杏内生真菌抑菌活性的研究〔申屠旭萍等 2023,2023〕等。在银杏内生真菌的多样性研究上,周松林等〔2023〕采用随机引物扩增多态性技术分析了银杏内生刺盘孢的遗传多样性,甘金莲等〔2023〕探讨了银杏内生真菌生态分布的一些特征,樊有赋等〔2023〕那么研究了银杏内生真菌的种群多样性。本研究在江苏和山东两省的主要银杏栽培基地分别于春、夏、秋三季定点随机采样,通过菌种别离和鉴定以及别离率和多样性指数计算,分析了银杏叶部组织中内生真菌的组成、多样性和分布特征。
1 材料与方法
1.1 材料
分别于2023年春季〔5月〕、夏季〔8月〕及秋季〔11月〕在5个样点〔表1〕采集银杏叶样品。在每一采样地点,随机选取相隔一定距离的假设干健康的银杏植株采样。样品标记后置于保鲜袋中,于4℃保存,在12h之内对样品进行内生真菌的别离。
1.2 培养基
马铃薯葡萄糖琼脂培养基〔PDA〕:马铃薯200g,葡萄糖20g,琼脂20g,水1000mL,pH值自然,临用时加250mg/L链霉素。
1.3 内生真菌的别离、纯化及保藏
采用常规的真菌组织别离法〔方中达 1998〕。叶片剪成0.5cm×0.5cm左右的组织小块,叶柄剪成1cm长的小段。每次别离均选取叶片组织块200个,叶柄组织块50个。
表1 银杏叶组织采样地点及其生境
Table 1 Sampling site and habitat of the leaves of Ginkgo biloba
采样地点
Sampling site
采样生境
Habitat
江苏南京
Nanjing, Jiangsu
公园
Park
江苏泰兴
Taixing, Jiangsu
种植园
Plantation
江苏启东
Qidong, Jiangsu
公园
Park
江苏邳州
Pizhou, Jiangsu
种植园
Plantation
山东郯城
Tancheng, Shandong
种植园
Plantation
1.4 内生真菌的鉴定
依照真菌的经典分类鉴定方法,从纯化后培养数日的菌落上挑取菌体制成切片,置于光学显微镜下观察菌丝、有性或无性孢子、产孢结构等的形态特征,鉴定到属。真菌分类鉴定的工具书主要为真菌鉴定手册〔魏景超 1979〕,半知菌的鉴定那么主要依据Barnett & Hunter〔1998〕的系统,并根据Kirk et al.〔2023〕追寻属的变动采用目前的属名和定义。
1.5 数据处理
采用别离频率比拟判断优势菌群。别离频率〔isolation frequency,IF〕:别离到的某一指定类型内生真菌的菌株数占别离总的内生真菌菌株数的百分率。
采用别离率衡量植物组织中内生真菌的丰富程度和每个组织块受多重侵染的发生频率。别离率〔isolation rate,IR〕:别离到的某一指定类型内生真菌的菌株数占别离样品组织块总数的百分率。
采用Shannon-Wiener指数〔H〕和Simpson指数〔D〕分析内生真菌的群落生物多样性。H=-Σ(Pi)(ln Pi)、D=1-Σ(Pi)2,式中:Pi为属于种i的个体在全部个体中的比例;采用Evenness指数〔J〕分析群落物种分布的均匀程度。J=H/lnS,式中:H为Shannon-Wiener指数、S为物种总数目;采用Sorenson〔Cs〕及Jaccard〔CJ〕相似性系数比拟两地之间内生真菌种类组成的相似程度。CS=2j/(a+b),CJ=j/(a+b-j),式中:j为两个样地共有种数或属数;a和b分别为样地A和样地B的物种数或属数。
2 结果分析
2.1 内生真菌的组成
从五个地点三个季节采集的银杏叶中共别离得到内生真菌1971株,鉴定后归于32属,少数因不产孢而未鉴定出种属的暂归为一类——无孢菌群〔Sterile mycelia〕。别离得到的内生真菌多属于半知菌〔94.82%〕,少数属于子囊菌〔2.38%〕。在目的分类水平上以半知菌中的丛梗孢目Moniliales和球壳孢目Sphaeropsidales为优势菌群,分别占总菌株数的37.85%和31%;在科的分类水平上以球壳孢科、暗梗孢科、黑盘孢科为优势菌群,分别占总菌株数的30.84%、27.84%和10.75%;在属的水平上以交链孢属Alternaria、叶点霉属Phyllosticta、丝核菌属Rhizoctonia为优势类群,分别占总菌株数的18.01%、14.66%和14.56%〔表2〕。
2.2 内生真菌的差异分布
2.2.1 内生真菌在不同部位的分布:各采样地春季
柄中内生真菌的别离率均高于叶片,而夏、秋两季时叶片中内生真菌的别离率那么显著高于叶柄〔图1〕。但是,叶片和叶柄内生真菌的种群组成却根本一致,优势菌群均为交链孢属Alternaria、叶点霉属Phyllosticta和丝核菌属Rhizoctonia。
2.2.2 内生真菌的地理分布:在5个采样调查地区之间,银杏叶中内生真菌的菌群组成存在差异,在别离率上表现为南京>启东>邳州>郯城>泰兴的规律〔图1〕。除共有的优势菌群以外,银杏叶部内生真菌还具有其各自地区的优势菌群。其中,南京为盘长孢属Gloeosporium〔3.55%〕,泰兴为匐柄霉属Stemphylium〔1.07%〕,启东为刺盘孢属Colletotrichum〔3.65%〕,邳州为闭果霉属Sclerotiopsis〔1.17%〕,郯城为拟茎点霉属Phomopsis〔3.75%〕。此外,局部内生真菌也具有一定的地理分布特性,泰兴为拟青霉属Paecilomyces〔0.05%〕和单格孢属Ulocladium〔0.10%〕,郯城为丝葚霉属Papulospora〔0.15%〕,邳州为黑腐菌属Guignardia〔0.15%〕,南京为小丛壳属Glomerella〔0.10%〕〔表3〕。
2.2.3 内生真菌在不同季节的分布:在春、夏、秋三个季节中,春季内生真菌的别离率为7.76%,显著低于夏季的19.76%和秋季的25.04%〔图1〕。在
图1 银杏叶片和叶柄内生真菌菌群别离率随季节的变化
Fig. 1 The seasonal change of isolation rate of endophytic fungi in blade and petiole of Ginkgo biloba. Spr., Spring; Sum.,