caspase家族及在细胞凋亡中的作用admin注:本文仅是基础知识，目前这方面进展十分快，需要更新更多的知识。如caspase家族目前发现至少14种。这里仅介绍几种常见的成员。目的是让大家了解到caspase家族的概况，以及在细胞凋亡中的作用。一caspase家族蛋白酶的组成未活化的caspase家族蛋白酶是以酶原形式存在的，酶原的氨基端有一段被称为“原结构域”(pro-domain)的序列。酶原活化时不但要将原结构域切除，并且要将剩余部分剪切成一大一小两个亚基，分别称为P20和P10，活性酶就是由这两种亚基以(P20/P10)2的形式组成的。这种活化反应也是Asp特异的，剪切发生在酶原中保守序列的Asp与其后的氨基酸残基之间，一般是先切下羧基端的小亚基，然后再从大亚基的氨基端切去原结构域。这种剪切可以是酶原及中间活性酶自我催化，也可以是其它ICE家族蛋白酶的作用，还有其它酶类如颗粒酶B参与。表5.caspase家族蛋白酶的识别序列及作用底物蛋白酶名称别名识别序列底物caspase1ICEYVADpro-IL-1b,pro-caspase3,pro-caspase4caspase4TX,ICH-2,ICErel-IIpro-caspase1caspase5ICErel-III,TYmICH3mICH4caspase2ICH-1PARPcaspase9ICE-LAP6,Mch6PARPcaspase3CPP32,Yama,apopainDEVDPARP,DNA-PK,SRE/BP,rho-GDI,KCqcaspase6Mch2VEIDlaminAcaspase7Mch3,ICE-LAP3,DEVDPARP,pro-caspase6CMH-1caspase8MACH,FLICE,Mch5DEVDpro-caspase3,4,7,9,10caspase10Mch4YVADcaspase11ICH3,FLICE2CED-3已命名的caspase家族成员均已克隆成功，它们不但在氨基酸序列上具有同源性，而且在空间结构上也很相似。目前已经获得了caspase-1(ICE)和caspase-3(CPP32)的X线结晶图像，结果显示它们具有相似的空间结构，在P20的C端和P10的N端有200多个氨基酸残基的序列尤为保守，在空间结构上组成相似的b折叠中心和相邻的a螺旋，保守的、对蛋白酶活性有特殊意义的氨基酸残基均位于这一段，并形成特定的结构。不同源的序列主要存在于P20的N端和P20与P10交界处，这两个部位的氨基酸残基在蛋白酶活化过程中一般被全部或部分切除。所有的成员都保守性地包含有与底物P1Asp作用的氨基酸残基，如在ICE中，它们是催化中心的Cys285，与酶/抑制剂复合物的巯基半缩醛以氢键结合的His237，以及可以稳定反应中间物氧阴离子的Gly238。另外，Arg179、Arg341、Gln383和Ser347形成容纳P1Asp的“口袋”，Ser339靠近Cys285的巯基，以氢键结合P1位的酰胺。与P2~P4作用的氨基酸残基则变异比较大，这可能是各个成员识别不同底...
